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ZZEF1

Models

# panel tissue h2 h2 se h2 P eQTL R2 BLUP R2 ENET R2 BSLMM R2 LASSO R2 eQTL P BLUP P ENET P BSLMM P LASSO P
1 GTEx Breast Mammary Tissue (Female) 0.1085 0.0706 4.6e-02 -0.009 NA -0.008 NA -0.004 7.2e-01 NA 7.0e-01 NA 4.6e-01
2 GTEx Muscle Skeletal 0.1119 0.0426 1.5e-03 0.006 NA 0.009 NA 0.012 7.4e-02 NA 4.4e-02 NA 1.9e-02
3 GTEx Thyroid 0.1480 0.0460 1.2e-05 0.065 NA 0.087 NA 0.083 1.1e-05 NA 3.5e-07 NA 6.6e-07
4 ROSMAP Brain Pre-frontal Cortex 0.0683 0.0213 4.7e-07 0.062 0.052 0.055 0.052 0.057 2.1e-08 2.7e-07 1.1e-07 2.8e-07 8.1e-08
5 YFS Blood 0.0585 0.0141 2.4e-11 0.029 0.039 0.061 0.060 0.059 9.2e-10 9.0e-13 2.3e-19 7.5e-19 1.7e-18

Trait associations

Trait Avg chi2 ratio Avg chi2 Max chi2 1 2 3 4 5
1.4 1.0 2.0 1.0 1.1        
2.4 2.4 2.8 1.2 0.4        
0.6 -0.2 -0.8 -1.5 -1.5        
-1.5 -2.6 -1.4 -3.2 -2.3        
0.4 0.6 2.9 2.2 2.3        
-0.7 -1.2 -1.2 -2.2 -1.5        
1.9 2.3 2.0 0.7 -0.4        
1.1 1.1 0.0 -0.4 -0.6        
-1.3 -2.0 -1.3 -1.3 0.2        
-0.4 0.3 1.1 -0.6 -1.3        
1.7 0.4 0.9 1.6 1.3        
0.0 -0.3 0.7 -0.5 -0.8        
0.5 1.2 0.4 1.2 1.0        
-0.7 0.2 -0.7 -0.8 -0.9        
-0.9 -0.6 -1.3 -1.8 -1.9        
0.0 0.0 0.0 -0.8 -1.0        
2.3 3.0 1.5 2.3 0.2        
1.7 1.6 3.5 2.6 3.6        
-1.1 -0.7 -1.9 -0.6 0.9        
0.6 1.2 1.3 2.1 1.8        
-1.1 -1.8 -1.9 -1.4 -0.8        
-0.0 0.1 1.1 -0.7 -0.4        
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0        
1.0 -0.3 0.5 0.3 0.8        
0.8 2.1 0.0 1.1 0.1        
1.3 1.0 0.4 0.5 0.1        
1.6 0.9 0.9 0.9 -0.1        
0.2 1.1 0.2 1.6 1.2        
1.1 1.9 2.1 1.7 0.2        
-0.7 -0.4 -0.7 -1.9 -1.7        
1.7 1.1 1.1 2.6 1.7        
0.0 -1.6 -1.3 -2.3 -3.0        
1.4 1.0 0.6 0.1 -0.7        
0.2 0.1 1.2 0.1 -0.8        
-1.4 -1.0 -1.3 -3.1 -3.6        
2.2 2.8 2.5 0.7 -0.0        
-0.1 0.5 0.6 0.2 0.0        
1.1 2.2 1.6 2.9 2.5        
-1.0 -0.9 -1.4 -2.5 -1.8        
0.4 1.4 -2.2 0.2 0.4        
-4.5 -4.0 -4.8 -6.3 -4.7        
-0.7 1.1 0.4 1.7 2.2        
-2.3 -0.1 -2.7 -1.5 -1.6        
3.9 5.3 4.4 4.5 2.9        
3.1 4.0 4.3 4.8 4.2        
1.0 5.0 1.5 4.3 2.8        
5.6 4.7 3.2 4.5 2.3        
1.3 1.7 0.6 1.2 0.1        
0.5 -0.7 -1.3 -0.9 -1.1        
0.1 -1.0 -0.8 0.7 0.9        
2.6 4.8 2.8 4.6 3.5        
-2.0 -0.1 -1.0 -0.7 -0.0        
-1.8 -0.2 -2.1 -1.3 -0.6        
3.4 4.4 3.5 5.2 4.1        
8.2 7.1 6.6 9.6 6.7        
-3.3 -2.5 -4.7 -4.5 -3.1        
-1.1 -1.2 -1.6 -1.6 -0.8        
2.6 4.6 3.2 4.1 3.0        
-1.1 -1.0 -2.0 -0.5 0.4        
0.0 -1.0 -0.6 -1.5 -0.8        
-2.2 -2.4 -1.7 -1.4 0.9        
0.4 2.1 -0.4 1.4 0.8        
-1.6 -1.0 -1.5 -1.1 -0.6        
0.1 -0.3 -1.5 -0.2 -0.7        
-1.6 -2.4 -1.7 -2.6 -1.3        
0.0 0.6 0.7 0.6 -0.3        
-1.2 -2.4 -1.5 -1.9 -2.1        
-0.2 2.1 0.1 0.6 -0.7        
-0.2 -0.1 -1.1 -0.5 -0.8        
0.7 0.4 -1.1 1.2 1.3        
0.6 1.0 0.5 0.8 0.1        
0.9 0.7 0.6 1.2 0.5        
-0.4 0.8 -0.1 0.6 0.4        
-0.7 -0.7 -0.7 -0.6 -0.3        
-0.2 -1.1 -0.6 -0.7 -0.7        
-0.5 -2.0 -1.3 -1.3 -0.5        
-1.4 0.1 1.1 0.2 0.4        
1.4 3.5 1.9 2.6 1.8        
1.3 3.4 2.9 2.8 1.3        
2.5 1.9 1.2 2.8 2.0        
-0.7 -1.2 -1.3 -1.6 -1.2        
0.3 0.0 0.5 0.9 0.2        
2.0 1.3 -0.4 0.8 -0.0        
0.8 3.1 2.8 2.6 2.8        
2.8 5.2 3.1 4.6 3.3        
-1.6 -1.7 -0.6 -0.8 1.9        
-0.7 -0.9 -0.7 -1.9 -1.7        
-0.3 -2.5 -2.3 -0.8 -0.7        
0.5 1.5 1.9 2.7 1.9        
-0.2 0.4 -0.1 -0.5 -0.6        
-0.0 -0.4 -0.5 -1.4 -1.6        
-0.8 -2.7 -1.7 -2.5 -1.3        
-0.4 0.0 0.5 -0.7 -0.9        
-0.8 0.9 -2.4 -0.6 -1.4        
-0.1 -1.1 -1.8 -1.0 -0.6        
-0.7 -0.6 -1.1 -1.0 -0.9        
0.7 1.1 0.5 1.4 1.6        
0.3 -0.3 -0.4 0.2 -0.0        
-0.8 -0.6 -0.9 -0.8 -0.7        
-1.2 -1.4 -2.3 -1.4 -0.2        
2.2 5.5 3.2 3.6 2.1        
0.8 -0.8 0.3 0.9 1.2        
0.3 1.2 0.9 0.5 0.1        
0.0 0.1 -0.7 -0.3 -0.2        
-0.5 -0.2 -0.7 0.5 1.6        
0.2 0.2 0.6 0.5 0.7        
1.2 3.1 1.7 1.6 0.0        
-1.9 0.5 0.9 -0.8 0.1        
0.5 2.3 1.9 1.8 1.6        
0.3 -0.7 2.1 0.1 0.3        
0.5 2.6 1.2 2.7 2.1        
1.7 3.6 3.3 3.3 2.8        
1.8 1.0 -0.5 0.6 -0.5        
0.8 3.1 2.7 2.6 2.8        
2.8 5.5 3.5 4.7 3.5        
2.9 5.2 3.8 4.5 3.2        
-0.5 -0.5 -1.2 -0.7 -1.4        
0.2 -1.1 -0.5 1.1 1.4        
-0.8 0.1 -0.5 -0.5 -1.5        
-1.8 -1.8 -1.0 -1.1 -0.3        
-2.4 -2.8 -2.6 -3.8 -2.6        
-0.3 0.1 -0.1 -0.2 0.1        
-1.3 -1.2 -1.8 -1.2 -0.3        
0.6 1.0 -0.5 -0.6 -1.3        
0.7 1.0 1.5 1.5 1.2        
-1.6 -0.5 -1.9 -0.8 0.1        
1.2 1.3 0.7 0.9 0.3        
0.8 0.6 0.4 -0.6 -1.2        
-0.6 -0.7 -2.5 -1.1 -0.8        
-0.7 -1.6 -0.5 -1.1 0.4        
0.5 -0.0 1.0 0.6 0.5        
0.8 1.3 -0.2 1.3 0.9        
0.3 0.7 0.4 -0.1 -0.6        
-2.1 -0.5 0.5 -1.1 -1.2        
2.6 3.1 3.2 2.9 2.1        
0.5 0.9 0.2 0.9 0.7        
2.7 3.9 2.4 3.3 1.7        
0.3 2.0 1.6 2.6 1.9        
1.0 1.5 3.2 2.7 3.8        
0.9 -1.3 0.6 -0.3 -0.7        
-1.2 -1.3 -1.3 -1.5 -0.8        
2.5 5.1 3.8 4.2 3.4        
-0.2 -0.2 -1.9 -0.3 -1.0        
1.8 4.1 2.5 3.7 2.9        
1.4 3.6 3.0 2.8 2.8        
1.4 4.1 3.0 3.4 3.1        
0.2 0.2 -0.8 -0.5 -0.6        
0.7 1.0 -0.1 0.7 0.4        
-0.9 -1.8 -1.4 -1.9 -1.6        
-1.2 -1.2 -0.5 -0.6 0.2        
-2.5 -1.9 -1.6 -2.4 -1.4        
-1.1 -0.6 -1.0 -1.2 -0.5        
-0.9 -1.4 0.7 -1.3 -1.7        
2.4 1.6 0.6 2.2 1.0        
0.2 0.9 -0.3 1.5 1.9        
1.0 1.7 0.4 1.5 1.3        
0.8 1.1 0.5 -0.2 -0.1        
2.0 0.6 1.2 1.8 1.5        
2.2 1.9 3.0 1.9 0.7        
0.2 -0.9 -0.5 -0.4 -0.0        
-1.8 -1.2 -2.7 -1.6 -1.3        
-1.4 -0.4 -2.2 -1.3 -0.7        
-2.7 -1.9 -1.8 -2.2 -1.9        
-0.3 1.1 0.9 1.7 1.4        
-0.8 -2.0 -1.0 -1.9 -1.1        
-1.2 -0.3 -1.2 -1.1 -1.2        
0.3 0.3 -0.3 -0.5 -1.3        
0.2 0.2 -1.0 0.3 0.2        
-0.0 -1.2 -0.9 -1.3 -0.9        
0.9 1.1 0.3 1.8 1.8        
1.5 1.0 1.1 1.4 0.7        
-0.7 -0.4 -1.9 -0.9 -1.0        
2.4 4.7 3.3 4.1 3.3        
1.3 3.6 3.0 2.8 2.9        
2.0 4.1 1.6 2.9 2.1        
0.4 -1.2 0.3 -0.5 0.1        
0.6 1.7 0.7 1.2 1.0        
0.4 -0.3 -0.5 0.5 -0.1        
-2.0 -1.4 -2.5 -1.6 -0.9        
-1.5 -0.5 -0.5 -0.8 -1.3        
0.8 2.3 0.2 0.9 0.1        
0.2 0.9 1.5 0.5 0.4        
-0.7 0.5 0.0 1.7 2.1        
0.5 -0.2 0.3 0.5 0.0        
0.3 0.4 0.1 0.4 0.6        
0.2 0.4 0.3 -0.8 -0.5        
0.5 0.8 2.5 0.6 -0.5        
0.9 1.6 0.9 1.5 0.7        
0.4 1.0 -0.4 1.1 1.1        
-2.8 -1.9 -1.7 -3.0 -2.2        
0.5 0.8 0.0 -0.1 -0.0        
-0.7 -2.9 -1.0 -2.7 -1.4        
0.6 0.7 -0.4 -0.1 -0.7        
-1.3 0.6 -0.6 -0.7 -1.9        
-2.6 0.0 -1.0 -1.6 -0.8        
2.4 2.2 1.8 2.3 1.7        
-0.1 -0.7 -2.4 -0.6 -0.8        
3.3 3.0 3.6 3.4 2.0        
-1.7 -0.2 -1.7 -1.6 -1.4        
0.9 2.0 0.2 1.6 1.9        
-1.2 -0.5 -1.6 -0.8 -0.3        
3.0 5.1 3.1 4.6 3.3        
3.3 5.0 3.5 4.4 3.3        
1.9 3.7 3.2 3.2 3.4        
-1.1 0.4 -0.1 0.6 1.3        
2.3 1.4 1.5 0.6 -0.1        
0.5 1.6 0.8 0.9 0.3        
-0.5 0.1 0.8 -0.3 0.1        
-1.1 -0.4 -1.0 -1.9 -2.4        
1.0 1.5 -1.0 0.2 -0.5        
-0.3 -1.1 0.0 -0.7 -0.5        
1.3 0.5 1.4 1.6 0.9        
1.1 -0.2 0.7 0.5 0.7        
-1.4 -0.6 -1.0 -1.2 -0.7        
0.1 0.3 -1.0 -0.2 0.4        
0.2 1.5 -1.0 0.4 0.8        
2.6 2.0 1.1 1.8 0.1        
-0.1 -0.6 0.8 0.1 -0.1        
1.3 1.4 0.9 0.8 0.8        
-0.9 -0.8 -1.1 -1.2 -1.2        
2.1 0.4 2.0 2.0 1.9        
-0.6 -1.7 -1.2 -0.5 0.7        
1.0 3.9 1.6 3.5 2.2        
-0.9 0.4 -0.5 0.1 0.1        
0.5 1.1 1.4 0.8 0.9        
-2.3 -1.9 -0.9 -1.5 -0.8        
-0.6 1.3 -0.1 -0.7 -1.7        
-0.4 -0.2 -2.0 -0.8 -0.7        
-0.4 -1.9 -1.0 -2.7 -2.1        
2.4 3.2 1.4 2.3 -0.1        
-0.8 -0.3 -0.3 0.6 0.7        
-1.5 -1.4 -0.1 -1.9 -2.0        
2.9 5.3 3.7 4.8 3.6        
3.1 4.9 3.6 4.5 3.8        
1.9 3.6 3.1 3.1 3.3        
1.8 2.7 0.8 1.7 0.7        
-1.1 0.3 0.2 1.3 1.8        
1.9 4.2 2.6 2.9 2.0        
-0.8 0.6 -1.7 -0.4 -1.4        
-0.0 -0.5 0.6 0.4 1.2        
-1.1 0.2 -1.2 -1.4 -1.5        
-0.7 0.6 -0.6 -0.2 -1.4        
-0.4 -0.9 -1.0 -1.0 -0.9        
0.4 0.2 1.4 0.6 0.6        
0.8 1.6 0.6 0.5 -0.2        
1.6 -0.9 0.3 0.7 1.0        
1.1 0.4 0.7 1.3 1.3        
-0.2 -0.4 -0.3 -0.6 -0.2        
0.2 1.3 1.3 0.5 -0.0        
1.5 1.6 0.4 1.1 0.6        
0.7 1.7 0.7 1.7 1.1        
0.7 1.0 1.7 0.7 0.6        
2.6 5.6 3.4 3.6 2.0        
-0.6 -0.6 -1.5 -1.2 -1.3        
-1.7 -0.6 -1.6 -1.3 -1.7        
1.4 1.3 0.7 1.8 0.5        
-0.1 1.3 0.7 -1.0 -1.4        
0.4 1.8 2.1 1.1 0.8        
1.3 3.4 2.9 2.9 3.0        
0.6 2.5 2.4 2.3 2.5        
1.6 4.0 2.4 3.5 3.0        
-0.0 -0.1 1.5 0.2 0.1        
-0.1 -0.0 -0.5 0.4 0.5        
0.6 -0.6 -0.7 -1.4 -2.1        
0.6 -0.9 0.2 -1.0 -1.3        
1.2 2.1 0.2 1.2 0.4        
-0.1 0.2 -0.9 -1.4 -2.2        
2.7 3.9 3.8 3.2 2.1        
-1.0 -0.7 0.5 -0.5 -0.6        
1.2 1.6 1.1 0.7 0.8        
1.4 0.6 0.9 0.0 -1.3        
-0.2 0.2 -0.2 -0.9 -1.2        
-1.2 -0.7 -0.8 -1.2 -0.2        
-0.1 -0.2 0.6 -0.4 -1.0        
-2.0 -3.8 -2.4 -3.0 -2.3        
-0.2 -0.1 -0.1 -1.4 -2.6        
0.6 0.8 0.6 0.2 -0.1        
-1.3 -2.2 -1.6 -2.4 -2.3        
0.1 -0.1 0.1 0.3 0.8        
-1.4 -0.7 -2.1 -1.6 -0.7        
-0.6 -0.3 -1.4 -1.0 -1.7        
-0.1 1.2 0.4 0.1 0.1        
2.0 1.9 0.9 1.5 0.9        
1.1 3.0 2.2 2.6 1.8        
0.1 1.1 0.8 -0.1 0.1        
-0.2 -1.7 -1.8 -0.2 -0.1        
2.1 2.5 3.3 4.1 3.8        
1.3 3.4 2.8 2.8 2.9        
0.5 2.5 2.4 2.2 2.4        
2.4 4.7 3.2 4.2 3.6        
0.0 2.2 0.2 0.4 -0.4        
0.4 1.3 0.8 1.5 1.2        
-1.4 -0.7 -1.1 -2.0 -0.8        
0.1 -0.8 0.5 -0.4 -0.1        
0.3 -0.3 -1.0 -0.2 -0.6        
1.0 0.9 -0.4 -0.5 -2.1        
0.1 -0.4 0.6 -0.5 -0.6        
-0.8 -2.4 0.3 -1.1 -0.7        
-1.4 -1.4 -1.0 -1.6 -0.8        
-0.2 -0.4 -0.0 -0.9 -0.7        
-0.1 -0.8 -0.2 -1.1 -0.8        
0.7 0.2 -0.4 -0.3 -0.4        
2.9 4.7 3.2 3.3 1.9        
0.1 0.7 0.9 -0.7 -0.7        
0.8 2.6 2.0 2.0 1.2        
-0.1 0.6 1.3 0.7 0.4        
1.1 3.4 1.8 3.2 2.3        
-2.2 -1.6 -0.5 -2.4 -1.5        
0.7 2.1 0.6 1.7 0.9        
1.3 2.6 2.5 1.3 0.1        
-1.1 -1.1 -1.1 -0.6 0.1        
-2.6 -1.6 0.2 -0.9 0.0        
0.1 0.7 0.1 -0.9 -1.6        
1.7 3.9 3.2 3.3 3.2        
3.1 4.8 3.3 4.2 2.9        
2.0 4.2 3.2 3.3 2.9        
-1.6 -0.9 -0.2 -1.3 -1.1        
-0.0 0.7 0.4 -0.3 0.7        
-2.8 -2.2 -2.7 -3.8 -3.3        
1.5 0.5 0.7 1.4 0.1        
1.0 2.4 0.5 2.4 1.1        
0.2 -1.0 0.0 -1.1 -1.1        
0.7 1.7 0.5 -0.5 -1.6        
3.6 4.1 3.6 5.5 4.0        
0.9 1.8 0.6 0.8 0.0        
-2.0 -1.6 -0.9 -1.4 0.5        
0.3 -0.9 0.4 0.4 0.3        
1.6 1.8 1.9 2.1 1.0        
-1.5 -4.8 -2.6 -3.1 -2.1        
2.1 3.7 2.7 2.9 1.6        
-0.6 0.4 -1.7 -0.5 -0.7        
0.9 0.2 -0.2 0.4 -0.2        
-0.6 -0.9 -0.4 -1.2 -0.7        
0.2 0.7 1.1 0.5 0.3        
0.9 1.4 -0.4 1.2 0.9        
0.2 0.6 -0.5 0.9 1.1        
-1.3 0.6 0.4 -0.6 -0.3        
-0.4 1.1 -0.5 0.6 0.8        
0.4 0.3 0.4 1.1 0.3        
0.7 0.4 -1.3 0.0 -0.8        
2.9 5.0 3.6 4.4 3.5        
2.2 4.1 3.1 3.5 3.2