[Hub]/) : Traits : Blood White Count : ← →

chr4:82,645,452-84,691,811

Best TWAS P=2.93e-56 · Best GWAS P=1.48e-55 conditioned to 1

Associated models

#	Study	Tissue	Gene	h2	eQTL R2	model	# weights	model R2	model R2 P	eQTL GWAS Z	TWAS Z	TWAS P	Top SNP corr	PP3	PP4	joint
1	CommonMind	Brain Pre-frontal Cortex	LIN54	0.06	0.08	lasso	2	0.07	1.1e-08	-5.3	5.3	1.1e-07	0.07	1.00	0.00	FALSE
2	CommonMind	Brain Pre-frontal Cortex	SCD5	0.28	0.40	enet	15	0.41	5.8e-54	-11.3	-12.9	4.1e-38	0.77	1.00	0.00	FALSE
3	GTEx	Adipose Subcutaneous	THAP9-AS1	0.08	0.05	lasso	2	0.04	1.7e-04	6.0	-6.0	1.9e-09	0.11	0.66	0.01	FALSE
4	GTEx	Adipose Visceral Omentum	THAP9-AS1	0.13	0.12	lasso	6	0.09	1.4e-05	6.0	-6.4	1.8e-10	0.11	0.95	0.00	FALSE
5	GTEx	Adrenal Gland	THAP9-AS1	0.20	0.07	lasso	4	0.04	1.8e-02	6.1	-6.0	2.4e-09	0.12	0.22	0.04	FALSE
6	GTEx	Artery Aorta	THAP9-AS1	0.19	0.14	enet	13	0.17	1.3e-09	6.0	-5.5	3.0e-08	0.09	1.00	0.00	FALSE
7	GTEx	Artery Coronary	ENOPH1	0.25	0.02	lasso	4	0.03	4.7e-02	4.9	-5.6	2.8e-08	0.13	0.07	0.05	FALSE
8	GTEx	Artery Tibial	THAP9-AS1	0.25	0.25	lasso	6	0.24	4.2e-19	6.0	-5.7	9.6e-09	0.11	1.00	0.00	FALSE
9	GTEx	Brain Cortex	THAP9-AS1	0.23	0.04	lasso	4	0.06	1.1e-02	6.0	-6.1	1.4e-09	0.11	0.18	0.08	FALSE
10	GTEx	Brain Frontal Cortex BA9	THAP9-AS1	0.18	0.13	lasso	8	0.13	2.3e-04	6.0	-6.0	2.0e-09	0.12	0.38	0.04	FALSE
11	GTEx	Brain Hippocampus	THAP9-AS1	0.31	0.15	lasso	5	0.10	2.3e-03	4.9	-5.4	5.6e-08	0.10	0.18	0.05	FALSE
12	GTEx	Breast Mammary Tissue	THAP9-AS1	0.16	0.12	lasso	6	0.11	2.7e-06	-4.9	-5.7	1.2e-08	-0.05	0.94	0.00	FALSE
13	GTEx	Cells Transformed fibroblasts	SCD5	0.17	0.02	lasso	11	0.13	5.4e-10	4.9	6.3	3.0e-10	-0.56	0.12	0.87	FALSE
14	GTEx	Cells Transformed fibroblasts	THAP9-AS1	0.33	0.37	lasso	9	0.36	2.1e-28	6.0	-6.1	1.0e-09	0.11	1.00	0.00	FALSE
15	GTEx	Colon Transverse	THAP9-AS1	0.14	0.02	lasso	2	0.05	2.6e-03	6.0	-5.2	1.5e-07	0.08	0.16	0.07	FALSE
16	GTEx	Esophagus Muscularis	TMEM150C	0.17	0.01	lasso	9	0.02	1.4e-02	-15.7	14.3	2.7e-46	-0.90	0.01	0.95	FALSE
17	GTEx	Heart Left Ventricle	TMEM150C	0.21	0.11	lasso	3	0.07	1.0e-04	-15.7	15.8	2.9e-56	-0.99	0.01	0.99	TRUE
18	GTEx	Lung	THAP9-AS1	0.07	0.05	lasso	4	0.03	3.9e-03	6.0	-6.0	1.5e-09	0.13	0.63	0.02	FALSE
19	GTEx	Muscle Skeletal	TMEM150C	0.16	0.02	lasso	4	0.06	2.2e-06	-15.7	13.3	1.5e-40	-0.76	0.01	0.99	FALSE
20	GTEx	Muscle Skeletal	THAP9-AS1	0.11	0.12	lasso	5	0.12	1.4e-11	6.0	-6.0	1.8e-09	0.12	1.00	0.00	FALSE
21	GTEx	Nerve Tibial	THAP9-AS1	0.08	0.00	enet	7	0.01	5.3e-02	6.1	-6.7	2.9e-11	0.06	0.17	0.18	TRUE
22	GTEx	Pituitary	TMEM150C	0.39	0.10	lasso	7	0.15	1.6e-04	-11.3	9.3	8.9e-21	-0.52	0.08	0.35	FALSE
23	GTEx	Testis	THAP9-AS1	0.21	0.12	enet	21	0.16	8.8e-08	6.0	-6.0	2.1e-09	0.07	0.97	0.00	FALSE
24	GTEx	Thyroid	TMEM150C	0.12	0.05	lasso	5	0.08	6.6e-07	-15.7	14.0	2.4e-44	-0.85	0.01	0.99	FALSE
25	GTEx	Whole Blood	COPS4	0.13	0.01	lasso	4	0.01	3.5e-02	-12.1	12.4	1.6e-35	-0.74	0.05	0.17	FALSE
26	METSIM	Adipose	TMEM150C	0.05	0.00	blup	470	0.02	9.9e-04	-12.1	6.1	1.3e-09	-0.55	0.04	0.90	FALSE
27	NTR	Blood	HNRPDL	0.03	0.00	bslmm	454	0.00	4.3e-02	1.3	6.6	4.6e-11	-0.40	0.04	0.11	FALSE
28	ROSMAP	Brain Pre-frontal Cortex	SCD5	0.22	0.15	lasso	9	0.17	7.8e-21	-15.5	14.6	5.8e-48	-0.93	0.01	0.99	FALSE
29	ROSMAP	Brain Pre-frontal Cortex	THAP9-AS1	0.24	0.29	bslmm	463	0.33	3.8e-44	6.0	-6.5	6.4e-11	0.08	1.00	0.00	FALSE
30	The Cancer Genome Atlas	Kidney Renal Clear Cell Carcinoma	TMEM150C	0.10	0.07	enet	13	0.09	9.4e-11	-10.8	11.8	4.1e-32	-0.56	0.00	1.00	FALSE
31	The Cancer Genome Atlas	Kidney Renal Papillary Cell Carcinoma	TMEM150C	0.12	0.12	enet	4	0.09	6.9e-06	3.7	5.3	1.1e-07	-0.22	0.82	0.02	FALSE
32	The Cancer Genome Atlas	Brain Lower Grade Glioma	THAP9	0.03	0.03	lasso	1	0.02	7.2e-04	6.0	-6.0	2.1e-09	0.12	0.01	0.91	FALSE
33	The Cancer Genome Atlas	Thyroid Carcinoma	TMEM150C	0.12	0.07	lasso	4	0.08	3.8e-08	-13.4	13.5	2.9e-41	-0.73	0.00	1.00	FALSE