[Hub]/) : Traits : Lung FEV1/FVC ratio :

chr14:22,600,863-24,464,590

Best TWAS P=1.71e-15 · Best GWAS P=7.74e-15 conditioned to 1

Associated models

# Study Tissue Gene h2 eQTL R2 model # weights model R2 model R2 P eQTL GWAS Z TWAS Z TWAS P Top SNP corr PP3 PP4 joint
1 CommonMind Brain Pre-frontal Cortex HAUS4 0.20 0.25 lasso 7 0.25 1.2e-29 -6.43 -6.7 2.7e-11 0.91 0.99 0.01 FALSE
2 CommonMind Brain Pre-frontal Cortex RBM23 0.15 0.03 bslmm 585 0.08 2.6e-10 2.51 -5.8 7.3e-09 0.24 0.08 0.92 TRUE
3 GTEx Adipose Subcutaneous HAUS4 0.37 0.30 enet 30 0.34 3.3e-28 -6.43 -6.9 7.1e-12 0.93 0.55 0.45 FALSE
4 GTEx Adipose Visceral Omentum HAUS4 0.29 0.17 lasso 14 0.21 5.2e-11 -6.93 -6.9 3.9e-12 0.94 0.01 0.99 FALSE
5 GTEx Adrenal Gland HAUS4 0.35 0.22 enet 11 0.21 3.5e-08 -7.04 -7.9 3.5e-15 0.91 0.05 0.95 TRUE
6 GTEx Artery Aorta HAUS4 0.35 0.26 enet 14 0.32 6.1e-18 -6.43 -7.4 1.1e-13 0.96 0.01 0.99 FALSE
7 GTEx Artery Aorta RP11-298I3.1 0.18 0.07 enet 12 0.08 2.6e-05 -7.77 7.7 2.0e-14 -0.98 0.01 0.99 FALSE
8 GTEx Artery Coronary HAUS4 0.36 0.25 lasso 5 0.22 8.6e-08 -7.67 -7.4 1.0e-13 0.95 0.03 0.97 FALSE
9 GTEx Artery Tibial HAUS4 0.39 0.33 enet 37 0.35 4.4e-28 -6.93 -7.0 2.6e-12 0.93 0.67 0.33 FALSE
10 GTEx Brain Caudate basal ganglia HAUS4 0.49 0.07 lasso 8 0.14 7.2e-05 -6.93 -5.4 7.5e-08 0.84 0.03 0.89 FALSE
11 GTEx Brain Cerebellum HAUS4 0.36 0.27 enet 6 0.32 2.6e-10 -6.77 -7.3 3.4e-13 0.92 0.03 0.97 FALSE
12 GTEx Brain Cerebellum RBM23 0.31 0.18 lasso 4 0.22 3.4e-07 -6.67 6.5 5.8e-11 -0.95 0.02 0.97 FALSE
13 GTEx Brain Frontal Cortex BA9 HAUS4 0.26 0.07 lasso 6 0.04 3.7e-02 -6.67 -7.3 3.6e-13 0.87 0.04 0.78 FALSE
14 GTEx Brain Putamen basal ganglia HAUS4 0.29 0.00 enet 4 -0.01 6.3e-01 -6.77 -6.8 7.9e-12 0.88 0.03 0.79 FALSE
15 GTEx Breast Mammary Tissue HAUS4 0.35 0.26 enet 21 0.23 4.6e-12 -6.43 -6.1 9.0e-10 0.87 0.17 0.83 FALSE
16 GTEx Breast Mammary Tissue (Male) HAUS4 0.30 0.12 lasso 11 0.10 2.6e-03 -6.43 -6.6 4.1e-11 0.90 0.02 0.91 FALSE
17 GTEx Cells Transformed fibroblasts HAUS4 0.22 0.10 enet 40 0.14 1.9e-10 -6.43 -5.5 5.0e-08 0.68 0.11 0.89 FALSE
18 GTEx Colon Sigmoid HAUS4 0.36 0.20 enet 23 0.18 4.2e-07 -6.43 -7.3 2.0e-13 0.85 0.04 0.95 FALSE
19 GTEx Colon Sigmoid RBM23 0.49 0.14 lasso 6 0.06 2.8e-03 -6.93 7.3 2.7e-13 -0.81 0.08 0.65 FALSE
20 GTEx Colon Transverse HAUS4 0.30 0.28 enet 8 0.27 3.2e-13 -6.91 -7.0 2.5e-12 0.94 0.34 0.66 FALSE
21 GTEx Esophagus Mucosa HAUS4 0.33 0.26 enet 17 0.28 7.4e-19 -7.77 -7.5 8.4e-14 0.97 0.01 0.99 FALSE
22 GTEx Esophagus Muscularis HAUS4 0.37 0.24 enet 41 0.28 1.5e-17 -6.96 -5.9 3.8e-09 0.89 0.13 0.87 FALSE
23 GTEx Heart Atrial Appendage HAUS4 0.28 0.14 lasso 4 0.10 1.9e-05 -6.96 -6.2 5.6e-10 0.89 0.04 0.94 FALSE
24 GTEx Heart Left Ventricle HAUS4 0.17 0.13 lasso 2 0.12 5.0e-07 -6.43 6.3 2.8e-10 -0.87 0.09 0.89 FALSE
25 GTEx Heart Left Ventricle RBM23 0.13 0.04 enet 9 0.07 1.2e-04 -3.45 6.1 1.2e-09 -0.79 0.11 0.65 FALSE
26 GTEx Lung HAUS4 0.30 0.26 enet 26 0.29 1.9e-22 -6.93 -6.5 8.6e-11 0.89 0.80 0.20 FALSE
27 GTEx Muscle Skeletal HAUS4 0.09 0.08 lasso 4 0.06 1.4e-06 -6.67 -6.9 4.0e-12 0.93 0.16 0.84 FALSE
28 GTEx Nerve Tibial HAUS4 0.36 0.29 enet 38 0.33 8.2e-24 -6.96 -6.9 5.5e-12 0.91 0.61 0.39 FALSE
29 GTEx Ovary HAUS4 0.32 0.10 enet 16 0.09 2.6e-03 -6.43 -5.8 5.5e-09 0.75 0.04 0.85 FALSE
30 GTEx Pancreas HAUS4 0.31 0.14 enet 23 0.12 1.4e-05 -6.96 -7.0 3.0e-12 0.92 0.02 0.98 FALSE
31 GTEx Pancreas RBM23 0.20 0.10 enet 7 0.03 1.7e-02 -6.98 6.4 1.9e-10 -0.94 0.07 0.74 FALSE
32 GTEx Skin Not Sun Exposed Suprapubic HAUS4 0.31 0.20 enet 21 0.24 3.2e-13 -6.43 -6.5 8.0e-11 0.88 0.26 0.74 FALSE
33 GTEx Skin Sun Exposed Lower leg HAUS4 0.31 0.25 enet 25 0.32 2.5e-27 -6.43 -6.8 1.2e-11 0.93 0.82 0.18 FALSE
34 GTEx Skin Sun Exposed Lower leg AJUBA 0.12 0.04 lasso 4 0.05 6.8e-05 -7.64 7.1 1.2e-12 -0.90 0.02 0.97 FALSE
35 GTEx Skin Sun Exposed Lower leg MRPL52 0.13 0.13 lasso 3 0.16 3.9e-13 4.63 5.3 1.1e-07 0.07 1.00 0.00 TRUE
36 GTEx Stomach HAUS4 0.29 0.20 enet 13 0.20 6.0e-10 -6.96 -7.5 7.7e-14 0.99 0.01 0.99 FALSE
37 GTEx Stomach RP11-298I3.1 0.29 0.16 lasso 9 0.14 2.4e-07 -7.77 8.0 1.7e-15 -0.97 0.01 0.99 TRUE
38 GTEx Thyroid HAUS4 0.29 0.23 enet 42 0.21 5.2e-16 -6.43 -6.4 1.5e-10 0.89 0.66 0.34 FALSE
39 GTEx Vagina HAUS4 0.37 0.18 enet 12 0.16 1.8e-04 -6.98 -7.1 1.7e-12 0.94 0.06 0.84 FALSE
40 GTEx Whole Blood PRMT5 0.15 0.14 lasso 4 0.12 3.7e-11 -5.10 5.8 5.5e-09 -0.78 0.59 0.41 FALSE
41 GTEx Whole Blood PRMT5-AS1 0.15 0.13 lasso 5 0.11 1.1e-10 -5.10 5.9 4.6e-09 -0.78 0.47 0.53 FALSE
42 METSIM Adipose HAUS4 0.12 0.11 lasso 6 0.11 2.1e-16 -6.34 -6.2 5.1e-10 0.88 0.86 0.14 FALSE
43 METSIM Adipose PPP1R3E 0.07 0.00 blup 462 0.02 5.3e-04 -0.38 -5.2 1.7e-07 0.19 0.10 0.04 TRUE
44 YFS Blood PRMT5 0.22 0.34 enet 24 0.35 1.3e-119 -5.10 6.0 2.1e-09 -0.77 1.00 0.00 FALSE
45 The Cancer Genome Atlas Bladder Urothelial Carcinoma HAUS4 0.09 0.04 lasso 5 0.04 5.1e-04 -6.93 -6.8 1.3e-11 0.92 0.10 0.81 FALSE
46 The Cancer Genome Atlas Breast Invasive Carcinoma HAUS4 0.03 0.06 blup 41 0.06 1.1e-12 -6.93 -7.1 9.2e-13 0.96 0.02 0.98 FALSE
47 The Cancer Genome Atlas Cervical Squamous Cell Carcinoma HAUS4 0.10 0.04 lasso 3 0.02 4.1e-02 -6.43 -5.4 5.3e-08 0.79 0.03 0.26 FALSE
48 The Cancer Genome Atlas Glioblastoma Multiforme HAUS4 0.21 0.23 blup 40 0.28 4.5e-09 -6.87 -7.5 6.2e-14 0.96 0.02 0.98 FALSE
49 The Cancer Genome Atlas Head and Neck Squamous Cell Carcinoma HAUS4 0.03 0.05 blup 41 0.04 8.4e-06 -6.34 -7.1 1.3e-12 0.96 0.04 0.96 FALSE
50 The Cancer Genome Atlas Kidney Renal Clear Cell Carcinoma HAUS4 0.09 0.11 blup 41 0.12 4.4e-13 -6.93 -5.8 5.4e-09 0.83 0.63 0.37 FALSE
51 The Cancer Genome Atlas Kidney Renal Papillary Cell Carcinoma HAUS4 0.17 0.17 lasso 4 0.19 2.7e-11 -7.04 -6.9 3.7e-12 0.92 0.20 0.80 FALSE
52 The Cancer Genome Atlas Brain Lower Grade Glioma HAUS4 0.11 0.20 lasso 7 0.22 5.5e-24 -6.34 -6.9 4.4e-12 0.93 0.55 0.45 FALSE
53 The Cancer Genome Atlas Brain Lower Grade Glioma RBM23 0.13 0.12 lasso 2 0.12 1.7e-13 -5.10 5.2 2.2e-07 -0.72 1.00 0.00 FALSE
54 The Cancer Genome Atlas Ovarian Serous Cystadenocarcinoma HAUS4 0.09 0.07 blup 41 0.08 8.0e-06 -7.77 -7.4 1.2e-13 0.98 0.01 0.99 FALSE
55 The Cancer Genome Atlas Pancreatic Adenocarcinoma HAUS4 0.12 0.19 lasso 4 0.21 4.8e-09 -7.76 -7.5 6.2e-14 0.95 0.01 0.99 FALSE
56 The Cancer Genome Atlas Pancreatic Adenocarcinoma PRMT5 0.21 0.04 lasso 4 0.04 8.8e-03 -4.39 -5.7 9.9e-09 0.48 0.02 0.18 FALSE
57 The Cancer Genome Atlas Pheochromocytoma and Paraganglioma HAUS4 0.12 0.15 lasso 4 0.15 1.3e-06 -6.93 -6.9 4.8e-12 0.94 0.12 0.82 FALSE
58 The Cancer Genome Atlas Prostate Adenocarcinoma HAUS4 0.12 0.15 blup 40 0.19 1.2e-19 -7.67 -6.7 1.8e-11 0.89 0.02 0.98 FALSE
59 The Cancer Genome Atlas Soft Tissue Sarcoma HAUS4 0.07 0.06 blup 40 0.08 1.3e-05 -6.93 -7.2 7.9e-13 0.95 0.04 0.95 FALSE
60 The Cancer Genome Atlas Skin Cutaneous Melanoma HAUS4 0.13 0.15 lasso 8 0.17 2.8e-05 -7.67 -7.4 1.5e-13 0.94 0.02 0.94 FALSE
61 The Cancer Genome Atlas Testicular Germ Cell Tumors HAUS4 0.12 0.07 blup 39 0.10 3.0e-04 -6.34 -7.2 7.2e-13 0.97 0.02 0.95 FALSE
62 The Cancer Genome Atlas Thyroid Carcinoma HAUS4 0.15 0.22 lasso 5 0.23 2.4e-22 -6.93 -7.2 6.2e-13 0.94 0.13 0.87 FALSE