[Hub]/) : Traits : Heel T-Score :

chr11:111,083,564-113,846,006

Best TWAS P=3.02e-147 · Best GWAS P=2.63e-221 conditioned to NaN

Associated models

# Study Tissue Gene h2 eQTL R2 model # weights model R2 model R2 P eQTL GWAS Z TWAS Z TWAS P Top SNP corr PP3 PP4 joint
1 CommonMind Brain Pre-frontal Cortex BCO2 0.54 0.53 bslmm 410 0.55 5.9e-81 2.82 -7.4 1.3e-13 -0.13 1.00 0.00 FALSE
2 GTEx Adrenal Gland NCAM1 0.30 0.00 enet 55 -0.01 6.1e-01 2.98 9.7 2.3e-22 0.17 0.10 0.13 TRUE
3 GTEx Adrenal Gland RPS12P21 0.29 0.29 enet 13 0.26 9.7e-10 2.82 -6.7 2.0e-11 -0.07 0.99 0.00 FALSE
4 GTEx Artery Tibial BCO2 0.16 0.06 lasso 7 0.09 2.0e-07 -8.92 -6.7 2.0e-11 -0.02 0.98 0.00 FALSE
5 GTEx Brain Cerebellar Hemisphere BCO2 0.23 0.20 lasso 6 0.20 6.6e-06 -9.94 -10.1 5.5e-24 -0.05 0.14 0.05 TRUE
6 GTEx Brain Cortex BCO2 0.31 0.18 lasso 6 0.18 1.2e-05 -9.94 -8.5 1.7e-17 -0.06 0.51 0.03 TRUE
7 GTEx Brain Frontal Cortex BA9 PIH1D2 0.30 0.00 enet 32 0.08 2.9e-03 1.05 7.0 2.7e-12 0.27 0.07 0.14 FALSE
8 GTEx Brain Putamen basal ganglia TIMM8B 0.28 0.01 lasso 6 0.01 2.2e-01 2.74 -6.8 1.1e-11 -0.17 0.06 0.08 FALSE
9 GTEx Colon Transverse BCO2 0.15 0.02 lasso 6 0.03 1.1e-02 -7.14 -9.5 2.4e-21 -0.09 0.12 0.07 FALSE
10 GTEx Esophagus Mucosa TIMM8B 0.23 0.01 enet 18 0.03 3.5e-03 0.55 -7.9 2.1e-15 -0.20 0.12 0.14 FALSE
11 GTEx Esophagus Mucosa BCO2 0.10 0.04 enet 34 0.08 5.1e-06 2.82 -15.1 1.7e-51 -0.25 0.30 0.13 TRUE
12 GTEx Esophagus Muscularis BCO2 0.14 0.12 lasso 5 0.11 3.5e-07 -8.99 -9.8 8.3e-23 -0.08 0.92 0.02 FALSE
13 GTEx Heart Atrial Appendage BCO2 0.22 0.13 enet 5 0.16 1.2e-07 2.82 -5.5 2.9e-08 -0.03 0.97 0.00 FALSE
14 GTEx Heart Left Ventricle BCO2 0.35 0.38 enet 29 0.40 1.2e-22 2.82 -7.1 9.9e-13 -0.09 1.00 0.00 FALSE
15 GTEx Heart Left Ventricle RPS12P21 0.26 0.26 enet 13 0.24 9.3e-13 2.82 -6.5 6.9e-11 -0.05 1.00 0.00 FALSE
16 GTEx Liver BCO2 0.23 0.24 lasso 3 0.22 6.7e-07 2.82 -5.1 3.1e-07 -0.03 0.58 0.02 FALSE
17 GTEx Muscle Skeletal RPS12P21 0.07 0.00 lasso 3 0.02 2.1e-03 7.22 -6.2 6.8e-10 -0.14 0.14 0.06 TRUE
18 GTEx Nerve Tibial RP11-356J5.12 0.24 0.12 lasso 12 0.13 1.6e-09 -23.13 -25.8 3.0e-147 -0.78 0.97 0.03 TRUE
19 GTEx Pancreas NCAM1 0.15 -0.01 enet 4 0.00 4.5e-01 8.81 -9.9 3.0e-23 -0.17 0.08 0.58 TRUE
20 GTEx Pancreas BCO2 0.34 0.10 enet 20 0.10 6.6e-05 -7.55 -10.6 3.0e-26 -0.14 0.95 0.01 FALSE
21 GTEx Pancreas RP11-356J5.12 0.25 0.04 lasso 8 0.06 1.5e-03 7.00 -12.2 5.3e-34 -0.31 0.68 0.11 FALSE
22 GTEx Skin Not Sun Exposed Suprapubic BCO2 0.18 0.11 enet 4 0.12 2.7e-07 -9.94 -9.9 5.4e-23 -0.07 0.98 0.00 FALSE
23 GTEx Skin Sun Exposed Lower leg IL18 0.11 0.07 lasso 4 0.07 1.0e-06 7.88 -7.2 8.6e-13 -0.10 0.85 0.01 FALSE
24 GTEx Skin Sun Exposed Lower leg BCO2 0.28 0.23 lasso 9 0.25 1.3e-20 -8.99 -9.1 9.5e-20 -0.05 1.00 0.00 FALSE
25 GTEx Thyroid RP11-356J5.12 0.42 0.34 lasso 10 0.36 1.2e-28 7.54 -7.0 2.1e-12 -0.16 1.00 0.00 TRUE
26 GTEx Vagina BCO2 0.43 0.12 lasso 7 0.11 1.8e-03 15.87 -16.5 5.9e-61 -0.52 0.09 0.18 FALSE
27 METSIM Adipose BCO2 0.17 0.06 bslmm 390 0.10 5.6e-15 2.97 -8.8 8.8e-19 -0.11 1.00 0.00 TRUE
28 METSIM Adipose DIXDC1 0.04 0.01 bslmm 360 0.02 1.4e-03 -1.68 -6.4 1.4e-10 -0.07 0.52 0.02 TRUE
29 METSIM Adipose NCAM1 0.07 0.05 enet 19 0.06 6.8e-09 10.31 -7.6 3.3e-14 -0.01 1.00 0.00 TRUE
30 ROSMAP Brain Pre-frontal Cortex CRYAB 0.03 0.00 blup 242 0.01 2.3e-02 0.26 5.2 2.0e-07 0.23 0.38 0.02 FALSE
31 ROSMAP Brain Pre-frontal Cortex BCO2 0.13 0.13 lasso 7 0.13 2.0e-16 2.72 -5.4 6.2e-08 -0.03 1.00 0.00 FALSE
32 YFS Blood CRYAB 0.02 0.00 enet 13 0.01 1.3e-05 1.35 -5.7 1.4e-08 -0.03 0.07 0.11 FALSE
33 YFS Blood DIXDC1 0.07 0.03 blup 353 0.06 2.7e-19 2.17 6.3 3.9e-10 0.21 1.00 0.00 FALSE
34 The Cancer Genome Atlas Breast Invasive Carcinoma BCO2 0.05 0.03 enet 12 0.04 2.6e-09 2.82 -11.2 3.0e-29 -0.16 0.90 0.10 FALSE
35 The Cancer Genome Atlas Breast Invasive Carcinoma IL18 0.03 0.02 enet 7 0.02 1.6e-05 7.32 -9.8 9.7e-23 -0.16 0.89 0.02 FALSE
36 The Cancer Genome Atlas Cervical Squamous Cell Carcinoma BCO2 0.08 0.02 blup 68 0.04 6.6e-03 -10.56 -9.4 3.5e-21 -0.09 0.06 0.20 FALSE
37 The Cancer Genome Atlas Colon Adenocarcinoma BCO2 0.05 0.00 blup 68 0.04 2.0e-03 6.04 -7.7 1.0e-14 -0.10 0.08 0.28 FALSE
38 The Cancer Genome Atlas Esophageal Carcinoma C11orf34 0.09 0.05 enet 4 0.04 2.1e-02 5.76 -7.0 2.5e-12 -0.15 0.04 0.04 FALSE
39 The Cancer Genome Atlas Glioblastoma Multiforme BCO2 0.20 0.11 blup 68 0.05 1.0e-02 1.35 -7.5 8.9e-14 -0.08 0.08 0.37 TRUE
40 The Cancer Genome Atlas Kidney Renal Papillary Cell Carcinoma BCO2 0.11 0.01 blup 69 0.01 9.0e-02 1.00 5.3 1.1e-07 0.10 0.04 0.07 FALSE
41 The Cancer Genome Atlas Lung Adenocarcinoma IL18 0.11 0.10 lasso 2 0.10 5.9e-12 7.32 -7.6 2.7e-14 -0.11 1.00 0.00 FALSE
42 The Cancer Genome Atlas Lung Squamous Cell Carcinoma BCO2 0.06 0.04 enet 9 0.04 3.3e-05 2.82 -5.5 2.9e-08 -0.02 0.64 0.05 FALSE
43 The Cancer Genome Atlas Lung Squamous Cell Carcinoma IL18 0.05 0.04 lasso 4 0.03 1.8e-04 7.32 -7.7 1.3e-14 -0.10 0.09 0.71 FALSE
44 The Cancer Genome Atlas Pheochromocytoma and Paraganglioma TEX12 0.15 0.02 blup 45 0.08 4.0e-04 3.34 7.3 3.3e-13 0.08 0.01 0.77 FALSE
45 The Cancer Genome Atlas Prostate Adenocarcinoma IL18 0.10 0.09 blup 50 0.09 1.6e-09 7.32 -7.5 7.5e-14 -0.06 1.00 0.00 FALSE