[Hub]/) : Traits : Mood swings :

chr8:8,092,025-11,860,845

Best TWAS P=6.76e-10 · Best GWAS P=8.46e-10 conditioned to 0.144

Associated models

# Study Tissue Gene h2 eQTL R2 model # weights model R2 model R2 P eQTL GWAS Z TWAS Z TWAS P Top SNP corr PP3 PP4 joint
1 GTEx Adipose Subcutaneous MTMR9 0.17 0.03 lasso 6 0.02 1.1e-02 5.4 5.5 3.1e-08 0.63 0.12 0.45 FALSE
2 GTEx Adipose Visceral Omentum AF131215.2 0.12 0.08 lasso 6 0.06 4.6e-04 -5.4 -5.7 1.5e-08 -0.86 0.15 0.83 FALSE
3 GTEx Adipose Visceral Omentum AF131215.9 0.18 0.16 lasso 7 0.16 2.0e-08 -5.4 -5.5 4.8e-08 -0.87 0.16 0.84 FALSE
4 GTEx Adrenal Gland AF131215.2 0.20 0.16 enet 12 0.13 2.2e-05 -5.0 -5.4 6.9e-08 -0.90 0.04 0.96 FALSE
5 GTEx Adrenal Gland AF131215.9 0.18 0.16 lasso 10 0.18 3.5e-07 -5.0 -5.4 6.7e-08 -0.87 0.09 0.91 FALSE
6 GTEx Artery Aorta AF131215.2 0.09 0.09 lasso 7 0.08 2.0e-05 4.5 -5.3 1.4e-07 -0.86 0.21 0.77 FALSE
7 GTEx Artery Aorta AF131215.9 0.13 0.05 lasso 6 0.07 1.3e-04 -4.6 -5.2 2.2e-07 -0.88 0.21 0.78 FALSE
8 GTEx Artery Tibial AF131215.9 0.08 0.01 lasso 10 0.02 1.8e-02 4.8 -5.2 2.6e-07 -0.71 0.10 0.84 FALSE
9 GTEx Brain Cerebellar Hemisphere AF131215.2 0.15 0.17 lasso 3 0.09 3.0e-03 5.7 -5.8 5.6e-09 -0.86 0.05 0.82 FALSE
10 GTEx Brain Cerebellum FAM86B3P 0.19 0.14 lasso 5 0.16 1.8e-05 -4.9 5.5 4.0e-08 0.65 0.04 0.95 FALSE
11 GTEx Breast Mammary Tissue AF131215.2 0.16 0.15 lasso 6 0.12 1.1e-06 4.5 -5.4 7.4e-08 -0.80 0.30 0.68 FALSE
12 GTEx Breast Mammary Tissue AF131215.9 0.10 0.10 lasso 8 0.12 8.7e-07 4.9 -5.3 1.2e-07 -0.79 0.27 0.72 FALSE
13 GTEx Cells EBV-transformed lymphocytes AF131215.2 0.20 0.10 enet 14 0.11 1.5e-04 5.7 -5.8 7.9e-09 -0.85 0.11 0.87 FALSE
14 GTEx Colon Sigmoid AF131215.2 0.10 0.00 enet 7 0.02 5.0e-02 -4.9 -5.8 6.2e-09 -0.76 0.10 0.60 FALSE
15 GTEx Colon Sigmoid AF131215.9 0.11 0.17 enet 5 0.09 4.9e-04 5.7 -6.0 1.7e-09 -0.87 0.05 0.90 FALSE
16 GTEx Colon Transverse AF131215.9 0.12 0.14 enet 18 0.12 4.0e-06 5.7 -5.4 5.6e-08 -0.88 0.04 0.95 FALSE
17 GTEx Esophagus Mucosa AF131215.2 0.15 0.14 enet 15 0.18 4.3e-12 5.0 -5.5 2.9e-08 -0.84 0.30 0.70 FALSE
18 GTEx Esophagus Mucosa AF131215.9 0.18 0.16 lasso 14 0.19 1.6e-12 -5.4 -5.7 1.2e-08 -0.89 0.12 0.88 FALSE
19 GTEx Esophagus Muscularis ERI1 0.12 0.09 enet 13 0.08 7.7e-06 -3.7 5.2 1.9e-07 0.61 0.13 0.86 FALSE
20 GTEx Esophagus Muscularis AF131215.2 0.10 0.08 lasso 5 0.09 2.3e-06 5.0 -5.2 2.3e-07 -0.81 0.46 0.53 FALSE
21 GTEx Esophagus Muscularis AF131215.9 0.14 0.17 enet 16 0.17 1.6e-10 5.7 -5.7 1.4e-08 -0.86 0.05 0.95 FALSE
22 GTEx Heart Left Ventricle AF131215.2 0.05 0.01 enet 11 0.01 1.5e-01 -5.4 -5.3 1.2e-07 -0.86 0.13 0.72 FALSE
23 GTEx Heart Left Ventricle AF131215.9 0.07 0.10 enet 8 0.10 9.4e-06 5.7 -5.7 1.2e-08 -0.87 0.06 0.93 FALSE
24 GTEx Lung AF131215.2 0.12 0.08 lasso 5 0.08 1.0e-06 5.7 -5.7 1.2e-08 -0.86 0.04 0.96 FALSE
25 GTEx Lung AF131215.9 0.15 0.18 lasso 4 0.15 1.5e-11 5.7 -5.7 1.2e-08 -0.86 0.04 0.96 FALSE
26 GTEx Nerve Tibial AF131215.2 0.19 0.18 lasso 12 0.23 3.5e-16 5.0 -5.5 3.2e-08 -0.89 0.17 0.83 FALSE
27 GTEx Nerve Tibial AF131215.9 0.17 0.17 lasso 4 0.18 5.0e-13 5.7 -5.6 1.9e-08 -0.86 0.04 0.96 FALSE
28 GTEx Pancreas AF131215.2 0.16 0.16 enet 17 0.15 9.1e-07 5.7 -5.9 4.9e-09 -0.88 0.11 0.89 FALSE
29 GTEx Pancreas AF131215.9 0.25 0.24 enet 14 0.22 1.0e-09 -4.6 -5.4 7.1e-08 -0.90 0.10 0.90 FALSE
30 GTEx Prostate AF131215.2 0.18 0.02 lasso 6 0.02 9.6e-02 -4.9 -5.6 1.9e-08 -0.74 0.07 0.56 FALSE
31 GTEx Skin Not Sun Exposed Suprapubic AF131215.2 0.16 0.11 enet 21 0.20 3.9e-11 5.0 -5.7 1.4e-08 -0.87 0.12 0.88 FALSE
32 GTEx Skin Not Sun Exposed Suprapubic AF131215.9 0.17 0.14 lasso 8 0.19 9.4e-11 5.7 -5.6 2.7e-08 -0.86 0.08 0.92 FALSE
33 GTEx Skin Sun Exposed Lower leg AF131215.2 0.14 0.11 lasso 9 0.16 4.3e-13 5.0 -5.4 6.3e-08 -0.85 0.44 0.56 FALSE
34 GTEx Skin Sun Exposed Lower leg AF131215.9 0.19 0.17 enet 29 0.21 3.9e-17 5.7 -6.2 7.5e-10 -0.86 0.07 0.93 FALSE
35 GTEx Spleen AF131215.2 0.16 0.08 enet 14 0.06 1.1e-02 5.7 -6.2 6.8e-10 -0.88 0.06 0.87 TRUE
36 GTEx Spleen AF131215.9 0.34 0.23 enet 16 0.15 1.2e-04 -5.5 -5.5 4.8e-08 -0.88 0.03 0.96 FALSE
37 GTEx Stomach AF131215.9 0.14 0.06 enet 19 0.06 6.7e-04 5.7 -5.4 7.1e-08 -0.83 0.02 0.97 FALSE
38 GTEx Thyroid SGK223 0.19 0.35 enet 16 0.36 1.1e-28 -4.8 5.2 1.6e-07 0.65 0.16 0.83 FALSE
39 GTEx Thyroid AF131215.2 0.11 0.15 enet 17 0.18 1.2e-13 5.0 -5.8 7.1e-09 -0.87 0.12 0.88 FALSE
40 GTEx Thyroid AF131215.9 0.11 0.08 enet 16 0.17 4.7e-13 5.7 -5.8 6.2e-09 -0.86 0.06 0.94 FALSE
41 GTEx Uterus AF131215.2 0.17 0.07 enet 13 0.09 7.1e-03 -5.0 -5.8 7.2e-09 -0.87 0.07 0.75 FALSE
42 GTEx Uterus AF131215.9 0.16 -0.01 enet 18 0.03 7.5e-02 -5.9 -6.1 7.8e-10 -0.80 0.06 0.76 FALSE
43 GTEx Vagina AF131215.9 0.21 0.11 lasso 9 0.08 6.3e-03 -5.9 -6.0 1.6e-09 -0.92 0.05 0.91 FALSE
44 NTR Blood MSRA 0.02 0.01 blup 833 0.01 2.3e-05 -4.9 5.1 2.9e-07 0.61 0.13 0.86 FALSE
45 ROSMAP Brain Pre-frontal Cortex XKR6 0.11 0.10 enet 23 0.13 1.2e-16 4.9 -5.4 8.4e-08 -0.81 0.14 0.86 FALSE
46 ROSMAP Brain Pre-frontal Cortex AF131215.3 0.08 0.10 lasso 7 0.12 8.3e-16 -4.9 -5.5 3.3e-08 -0.86 0.10 0.90 FALSE
47 ROSMAP Brain Pre-frontal Cortex AF131215.2 0.49 0.57 lasso 7 0.57 9.0e-89 5.7 -5.7 9.8e-09 -0.87 0.03 0.97 FALSE