[Hub]/) : Traits : Impedance of whole body : ← →

chr4:119,408,351-121,242,474

Best TWAS P=1.42e-19 · Best GWAS P=3.05e-19 conditioned to 1

Associated models

#	Study	Tissue	Gene	h2	eQTL R2	model	# weights	model R2	model R2 P	eQTL GWAS Z	TWAS Z	TWAS P	Top SNP corr	PP3	PP4	joint
1	CommonMind	Brain Pre-frontal Cortex	LOC645513	0.27	0.50	enet	50	0.51	2.1e-72	-7.95	8.1	4.0e-16	-0.89	0.98	0.02	TRUE
2	CommonMind	Brain Pre-frontal Cortex	PDE5A	0.05	0.04	lasso	2	0.03	8.1e-05	-8.13	8.3	8.2e-17	-0.89	0.19	0.81	FALSE
3	CommonMind	Brain Pre-frontal Cortex	USP53	0.16	0.13	lasso	11	0.20	3.5e-23	5.96	8.9	5.4e-19	-0.69	0.97	0.03	FALSE
4	GTEx	Adipose Subcutaneous	C4orf3	0.11	0.01	lasso	9	0.03	3.4e-03	-4.35	-5.2	2.5e-07	0.64	0.15	0.34	FALSE
5	GTEx	Adipose Subcutaneous	RP11-33B1.1	0.23	0.10	lasso	12	0.18	4.7e-15	5.35	8.5	2.2e-17	-0.72	0.15	0.85	FALSE
6	GTEx	Adipose Visceral Omentum	RP11-33B1.1	0.23	0.10	lasso	7	0.17	5.2e-09	-7.45	8.3	9.9e-17	-0.72	0.24	0.75	FALSE
7	GTEx	Adrenal Gland	RP11-33B1.1	0.13	0.07	enet	25	0.09	5.5e-04	-7.99	7.9	2.3e-15	-0.78	0.18	0.75	FALSE
8	GTEx	Adrenal Gland	RP11-33B1.4	0.11	0.10	enet	20	0.16	3.2e-06	-7.90	7.0	3.6e-12	-0.81	0.04	0.95	FALSE
9	GTEx	Artery Aorta	RP11-33B1.1	0.12	0.10	lasso	8	0.13	2.0e-07	-7.45	8.4	4.8e-17	-0.88	0.89	0.10	FALSE
10	GTEx	Artery Aorta	RP11-33B1.4	0.11	0.04	enet	15	0.04	1.7e-03	-7.90	-6.4	1.8e-10	0.82	0.33	0.61	FALSE
11	GTEx	Artery Coronary	RP11-33B1.1	0.21	0.16	lasso	10	0.22	7.4e-08	-7.96	7.7	1.3e-14	-0.75	0.60	0.39	FALSE
12	GTEx	Artery Coronary	RP11-33B1.4	0.10	0.02	lasso	2	0.01	1.5e-01	-7.49	-7.6	3.1e-14	0.79	0.14	0.45	FALSE
13	GTEx	Artery Tibial	C4orf3	0.04	0.00	enet	7	0.03	3.2e-03	-4.35	-7.0	3.5e-12	0.65	0.06	0.79	FALSE
14	GTEx	Artery Tibial	RP11-33B1.1	0.22	0.17	lasso	7	0.16	1.4e-12	-7.45	8.2	3.2e-16	-0.83	0.95	0.05	FALSE
15	GTEx	Artery Tibial	RP11-33B1.4	0.14	0.10	lasso	7	0.06	8.5e-06	-8.13	-7.2	4.9e-13	0.75	0.61	0.37	FALSE
16	GTEx	Brain Caudate basal ganglia	PDE5A	0.13	0.02	enet	12	0.06	6.4e-03	-8.07	8.6	9.9e-18	-0.79	0.09	0.70	FALSE
17	GTEx	Brain Caudate basal ganglia	RP11-33B1.1	0.27	0.34	lasso	2	0.29	5.9e-09	-8.13	8.3	1.4e-16	-0.85	0.24	0.76	FALSE
18	GTEx	Brain Caudate basal ganglia	RP11-33B1.4	0.12	0.16	lasso	4	0.15	5.7e-05	-8.41	8.8	1.1e-18	-0.97	0.05	0.91	FALSE
19	GTEx	Brain Cerebellar Hemisphere	RP11-33B1.1	0.35	0.34	lasso	8	0.33	2.5e-09	-8.13	8.5	2.7e-17	-0.82	0.22	0.74	FALSE
20	GTEx	Brain Cerebellar Hemisphere	RP11-33B1.4	0.13	0.05	lasso	4	0.01	1.6e-01	-7.85	-8.2	3.1e-16	0.90	0.10	0.58	FALSE
21	GTEx	Brain Cerebellum	RP11-33B1.1	0.31	0.30	lasso	11	0.32	2.9e-10	-8.13	8.2	2.7e-16	-0.78	0.75	0.24	FALSE
22	GTEx	Brain Cerebellum	RP11-33B1.4	0.14	-0.01	enet	18	-0.01	7.4e-01	-7.83	-8.5	2.6e-17	0.82	0.12	0.29	FALSE
23	GTEx	Brain Cortex	RP11-33B1.1	0.42	0.24	enet	23	0.28	1.7e-08	-8.13	6.8	8.5e-12	-0.64	0.71	0.23	FALSE
24	GTEx	Brain Frontal Cortex BA9	RP11-33B1.1	0.36	0.28	lasso	8	0.25	2.2e-07	-7.45	7.7	9.4e-15	-0.87	0.68	0.28	FALSE
25	GTEx	Brain Hippocampus	RP11-33B1.1	0.18	0.02	enet	20	0.05	2.2e-02	-8.07	7.4	1.6e-13	-0.74	0.19	0.39	FALSE
26	GTEx	Brain Hypothalamus	RP11-33B1.1	0.40	0.24	lasso	6	0.23	4.5e-06	-8.13	8.0	1.4e-15	-0.74	0.26	0.56	FALSE
27	GTEx	Brain Nucleus accumbens basal ganglia	MYOZ2	0.35	-0.01	enet	34	0.07	5.8e-03	6.24	-5.6	1.6e-08	0.41	0.07	0.43	FALSE
28	GTEx	Brain Nucleus accumbens basal ganglia	RP11-33B1.1	0.42	0.36	lasso	11	0.33	9.5e-10	-7.99	8.2	2.5e-16	-0.90	0.18	0.82	FALSE
29	GTEx	Brain Putamen basal ganglia	RP11-33B1.1	0.32	0.16	lasso	7	0.16	9.9e-05	-8.13	8.4	3.6e-17	-0.75	0.21	0.41	FALSE
30	GTEx	Breast Mammary Tissue	RP11-33B1.1	0.19	0.08	lasso	4	0.15	3.7e-08	6.92	8.5	1.3e-17	-0.68	0.67	0.33	FALSE
31	GTEx	Breast Mammary Tissue (Female)	RP11-33B1.1	0.31	0.29	enet	10	0.24	9.1e-08	5.94	7.0	2.2e-12	-0.44	0.83	0.09	FALSE
32	GTEx	Cells EBV-transformed lymphocytes	PDE5A	0.25	0.20	lasso	27	0.20	5.1e-07	-7.96	8.7	3.0e-18	-0.95	0.08	0.91	FALSE
33	GTEx	Cells EBV-transformed lymphocytes	USP53	0.13	0.01	lasso	5	0.02	8.8e-02	-7.49	7.3	3.0e-13	-0.84	0.04	0.69	TRUE
34	GTEx	Cells EBV-transformed lymphocytes	RP11-33B1.1	0.33	0.46	lasso	8	0.44	4.3e-16	-7.96	8.0	1.4e-15	-0.91	0.71	0.29	FALSE
35	GTEx	Cells Transformed fibroblasts	RP11-33B1.1	0.23	0.44	lasso	11	0.45	1.8e-37	-7.99	8.2	1.7e-16	-0.91	0.98	0.02	FALSE
36	GTEx	Colon Sigmoid	RP11-33B1.1	0.25	0.14	lasso	3	0.16	2.3e-06	-8.07	8.2	3.0e-16	-0.79	0.50	0.37	FALSE
37	GTEx	Colon Sigmoid	RP11-33B1.4	0.10	0.03	lasso	3	0.04	1.1e-02	-7.45	-7.7	1.3e-14	0.70	0.20	0.42	FALSE
38	GTEx	Colon Transverse	RP11-33B1.1	0.25	0.31	lasso	10	0.39	7.1e-20	-7.99	8.0	1.2e-15	-0.77	0.96	0.04	FALSE
39	GTEx	Esophagus Mucosa	RP11-33B1.1	0.25	0.29	lasso	12	0.36	3.3e-25	-7.96	8.4	5.4e-17	-0.78	0.96	0.04	FALSE
40	GTEx	Esophagus Muscularis	RP11-33B1.1	0.10	0.14	lasso	3	0.12	1.4e-07	-8.13	8.2	1.8e-16	-0.89	0.59	0.41	FALSE
41	GTEx	Esophagus Muscularis	RP11-33B1.4	0.16	0.00	enet	28	0.00	2.8e-01	0.46	-5.7	1.6e-08	0.54	0.20	0.23	FALSE
42	GTEx	Heart Atrial Appendage	MYOZ2	0.17	0.01	enet	16	0.02	5.7e-02	-8.74	-7.7	1.2e-14	0.71	0.06	0.73	FALSE
43	GTEx	Heart Atrial Appendage	RP11-33B1.1	0.15	0.08	lasso	3	0.10	4.0e-05	-7.93	8.3	1.1e-16	-0.76	0.66	0.29	FALSE
44	GTEx	Heart Atrial Appendage	RP11-33B1.4	0.12	0.10	lasso	4	0.05	2.0e-03	-8.13	-8.6	6.3e-18	0.85	0.28	0.37	FALSE
45	GTEx	Liver	RP11-33B1.1	0.18	0.12	enet	31	0.17	1.6e-05	-7.95	7.9	3.0e-15	-0.81	0.23	0.74	FALSE
46	GTEx	Liver	RP11-33B1.4	0.18	0.14	lasso	6	0.12	3.2e-04	-8.97	9.1	1.4e-19	-0.99	0.04	0.95	TRUE
47	GTEx	Lung	RP11-33B1.1	0.16	0.12	lasso	9	0.22	6.0e-17	4.07	7.7	1.3e-14	-0.65	0.98	0.02	FALSE
48	GTEx	Lung	RP11-33B1.4	0.10	0.10	lasso	5	0.09	4.2e-07	-7.90	-7.7	1.0e-14	0.90	0.75	0.24	FALSE
49	GTEx	Muscle Skeletal	RP11-33B1.1	0.04	0.03	lasso	3	0.02	8.1e-03	-7.95	8.1	6.5e-16	-0.86	0.33	0.62	FALSE
50	GTEx	Nerve Tibial	RP11-33B1.1	0.42	0.25	enet	32	0.35	1.1e-25	-7.45	7.4	1.3e-13	-0.69	0.97	0.03	FALSE
51	GTEx	Ovary	RP11-33B1.1	0.26	0.07	enet	33	0.16	1.2e-04	6.01	8.6	6.3e-18	-0.63	0.14	0.51	FALSE
52	GTEx	Ovary	RP11-33B1.4	0.13	0.07	lasso	3	0.02	1.2e-01	-7.49	-8.2	1.7e-16	0.86	0.08	0.34	FALSE
53	GTEx	Pancreas	RP11-33B1.1	0.13	0.18	lasso	5	0.18	4.7e-08	-7.99	8.9	3.8e-19	-0.88	0.48	0.52	FALSE
54	GTEx	Pancreas	RP11-33B1.4	0.20	0.05	lasso	16	0.05	3.8e-03	-8.41	8.4	2.9e-17	-0.96	0.02	0.97	FALSE
55	GTEx	Skin Not Sun Exposed Suprapubic	RP11-33B1.1	0.16	0.12	enet	9	0.13	1.0e-07	-7.45	7.4	1.7e-13	-0.73	0.72	0.26	FALSE
56	GTEx	Skin Sun Exposed Lower leg	USP53	0.07	0.00	enet	26	0.00	2.6e-01	-8.93	-5.3	1.1e-07	0.63	0.04	0.73	FALSE
57	GTEx	Skin Sun Exposed Lower leg	RP11-33B1.1	0.12	0.10	lasso	3	0.09	6.6e-08	4.07	6.4	1.5e-10	-0.37	1.00	0.00	FALSE
58	GTEx	Small Intestine Terminal Ileum	RP11-33B1.1	0.15	0.10	lasso	19	0.09	5.4e-03	-7.90	8.2	1.9e-16	-0.88	0.11	0.56	FALSE
59	GTEx	Spleen	RP11-33B1.1	0.22	0.03	enet	17	0.02	7.7e-02	5.96	8.3	1.3e-16	-0.71	0.10	0.45	FALSE
60	GTEx	Stomach	RP11-33B1.1	0.11	0.08	lasso	3	0.09	4.3e-05	-8.07	8.5	2.2e-17	-0.91	0.11	0.88	FALSE
61	GTEx	Testis	RP11-33B1.1	0.37	0.46	lasso	6	0.47	2.2e-23	-7.92	8.1	4.3e-16	-0.89	0.97	0.03	FALSE
62	GTEx	Testis	RP11-33B1.4	0.23	0.31	enet	16	0.37	1.5e-17	-7.95	8.9	5.1e-19	-0.97	0.04	0.96	FALSE
63	GTEx	Thyroid	PDE5A	0.09	0.04	lasso	3	0.04	6.9e-04	5.21	5.4	5.4e-08	-0.32	0.23	0.20	TRUE
64	GTEx	Thyroid	RP11-33B1.1	0.18	0.21	lasso	3	0.24	1.0e-18	-8.41	8.3	9.5e-17	-0.77	0.90	0.10	FALSE
65	GTEx	Thyroid	RP11-33B1.4	0.07	0.07	lasso	3	0.05	1.8e-04	-8.97	8.7	2.6e-18	-0.99	0.02	0.98	FALSE
66	GTEx	Uterus	RP11-33B1.4	0.23	0.24	lasso	4	0.16	4.9e-04	-7.91	-8.0	1.2e-15	0.83	0.12	0.32	FALSE
67	GTEx	Vagina	RP11-33B1.1	0.32	0.25	lasso	10	0.27	5.3e-07	-8.13	8.5	1.7e-17	-0.90	0.29	0.68	FALSE
68	GTEx	Whole Blood	C4orf3	0.11	0.16	lasso	6	0.16	3.0e-14	-8.41	-8.0	1.5e-15	0.91	0.18	0.82	FALSE
69	GTEx	Whole Blood	RP11-33B1.1	0.06	0.06	lasso	4	0.05	2.3e-05	-7.85	7.6	2.7e-14	-0.90	0.34	0.66	FALSE
70	GTEx	Whole Blood	RP11-33B1.4	0.13	0.16	lasso	9	0.15	1.4e-13	-7.95	-8.0	1.3e-15	0.91	0.96	0.04	FALSE
71	NTR	Blood	PDE5A	0.03	0.05	lasso	6	0.04	2.0e-13	-7.95	8.0	9.9e-16	-0.91	0.74	0.26	FALSE
72	NTR	Blood	USP53	0.10	0.10	bslmm	482	0.11	2.6e-34	5.94	5.6	2.1e-08	-0.14	1.00	0.00	TRUE
73	ROSMAP	Brain Pre-frontal Cortex	PDE5A	0.02	0.00	bslmm	442	0.01	7.3e-03	5.12	7.3	2.8e-13	-0.75	0.10	0.46	FALSE
74	ROSMAP	Brain Pre-frontal Cortex	USP53	0.06	0.04	blup	470	0.05	5.7e-07	-8.67	8.1	5.9e-16	-0.83	0.12	0.88	FALSE
75	ROSMAP	Brain Pre-frontal Cortex	RP11-33B1.1	0.22	0.42	lasso	5	0.42	1.4e-59	-7.45	8.1	6.7e-16	-0.87	1.00	0.00	FALSE
76	YFS	Blood	USP53	0.06	0.05	bslmm	479	0.06	8.1e-20	5.94	7.3	2.5e-13	-0.27	1.00	0.00	FALSE
77	The Cancer Genome Atlas	Colon Adenocarcinoma	FABP2	0.24	0.20	lasso	9	0.25	1.8e-14	6.24	-8.2	2.3e-16	0.86	0.06	0.94	FALSE
78	The Cancer Genome Atlas	Kidney Renal Clear Cell Carcinoma	USP53	0.07	0.05	blup	88	0.04	7.9e-06	6.70	6.8	8.7e-12	-0.55	0.68	0.18	FALSE
79	The Cancer Genome Atlas	Kidney Renal Papillary Cell Carcinoma	PDE5A	0.10	0.04	lasso	2	0.04	2.6e-03	-7.45	7.0	2.1e-12	-0.77	0.04	0.28	FALSE
80	The Cancer Genome Atlas	Thyroid Carcinoma	USP53	0.11	0.03	blup	88	0.07	5.8e-07	5.95	8.7	2.8e-18	-0.58	0.80	0.08	TRUE