[Hub]/) : Traits : Impedance of whole body : ← →

chr1:109,154,974-110,931,112

Best TWAS P=1.33e-15 · Best GWAS P=3.25e-15 conditioned to 0.0756

Associated models

#	Study	Tissue	Gene	h2	eQTL R2	model	# weights	model R2	model R2 P	eQTL GWAS Z	TWAS Z	TWAS P	Top SNP corr	PP3	PP4	joint
13	GTEx	Liver	SYPL2	0.34	0.27	lasso	5	0.30	4.6e-09	-7.54	-8.0	1.3e-15	0.88	0.04	0.96	TRUE
22	GTEx	Ovary	ATXN7L2	0.18	0.18	enet	17	0.13	5.6e-04	-7.85	8.0	1.8e-15	-0.99	0.03	0.94	FALSE
51	The Cancer Genome Atlas	Ovarian Serous Cystadenocarcinoma	MYBPHL	0.16	0.18	enet	10	0.17	2.3e-11	-7.85	-7.9	2.3e-15	0.99	0.01	0.99	FALSE
29	GTEx	Testis	SYPL2	0.45	0.50	enet	22	0.54	5.0e-28	-7.76	7.9	2.4e-15	-0.99	0.03	0.97	FALSE
21	GTEx	Ovary	SYPL2	0.39	0.44	lasso	5	0.46	8.8e-13	-7.85	7.9	3.4e-15	-0.97	0.03	0.97	FALSE
42	The Cancer Genome Atlas	Head and Neck Squamous Cell Carcinoma	SYPL2	0.03	0.05	lasso	4	0.05	6.6e-06	-7.76	-7.9	3.6e-15	0.98	0.01	0.99	FALSE
30	GTEx	Testis	ATXN7L2	0.28	0.34	lasso	4	0.33	3.7e-15	-7.87	7.9	3.8e-15	-0.99	0.02	0.98	FALSE
34	NTR	Blood	SORT1	0.05	0.06	lasso	6	0.06	2.1e-17	-7.85	-7.8	4.4e-15	0.98	0.02	0.98	FALSE
19	GTEx	Muscle Skeletal	CYB561D1	0.07	0.00	lasso	3	0.00	7.2e-01	-7.80	7.7	1.3e-14	-0.99	0.03	0.92	FALSE
53	The Cancer Genome Atlas	Prostate Adenocarcinoma	SYPL2	0.08	0.08	blup	44	0.10	1.9e-10	-7.51	-7.7	1.5e-14	0.92	0.05	0.95	FALSE
4	GTEx	Brain Cerebellum	SYPL2	0.16	0.02	enet	9	0.03	5.1e-02	-7.52	-7.7	1.7e-14	0.92	0.04	0.89	FALSE
60	The Cancer Genome Atlas	Thyroid Carcinoma	ATXN7L2	0.06	0.06	lasso	3	0.05	6.6e-06	-7.51	7.6	2.2e-14	-0.94	0.02	0.97	FALSE
26	GTEx	Stomach	SYPL2	0.23	0.18	lasso	8	0.21	2.3e-10	-7.54	-7.6	2.6e-14	0.90	0.04	0.96	FALSE
45	The Cancer Genome Atlas	Liver Hepatocellular Carcinoma	SYPL2	0.18	0.19	blup	45	0.18	4.7e-09	-7.87	-7.4	1.7e-13	0.95	0.01	0.99	FALSE
61	The Cancer Genome Atlas	Thyroid Carcinoma	SYPL2	0.07	0.04	blup	45	0.03	4.9e-04	-7.51	7.4	1.8e-13	-0.89	0.02	0.97	FALSE
33	METSIM	Adipose	SYPL2	0.06	0.06	blup	418	0.05	4.3e-08	-6.39	-7.3	3.1e-13	0.80	0.28	0.72	FALSE
44	The Cancer Genome Atlas	Liver Hepatocellular Carcinoma	MYBPHL	0.09	0.07	blup	46	0.06	5.7e-04	-6.50	-7.2	4.1e-13	0.81	0.01	0.77	FALSE
23	GTEx	Pancreas	SYPL2	0.28	0.23	lasso	5	0.19	2.0e-08	-6.53	-7.1	1.3e-12	0.92	0.05	0.95	FALSE
2	GTEx	Brain Cerebellar Hemisphere	SYPL2	0.28	0.04	lasso	5	0.09	2.7e-03	-7.54	-7.1	1.5e-12	0.90	0.06	0.89	FALSE
8	GTEx	Colon Sigmoid	SYPL2	0.15	0.06	enet	16	0.06	5.2e-03	-6.50	-7.0	2.3e-12	0.76	0.10	0.79	FALSE
14	GTEx	Liver	ATXN7L2	0.39	0.04	lasso	12	0.21	1.3e-06	-7.54	-7.0	2.7e-12	0.74	0.04	0.88	FALSE
3	GTEx	Brain Cerebellar Hemisphere	ATXN7L2	0.24	-0.01	enet	9	-0.01	5.3e-01	-3.59	-6.9	5.9e-12	0.64	0.04	0.33	FALSE
32	GTEx	Uterus	SYPL2	0.29	0.13	lasso	7	0.04	5.1e-02	-7.54	6.8	1.0e-11	-0.85	0.04	0.71	FALSE
50	The Cancer Genome Atlas	Ovarian Serous Cystadenocarcinoma	AMIGO1	0.06	0.00	blup	46	0.02	9.5e-03	-5.34	-6.8	1.0e-11	0.68	0.03	0.42	FALSE
47	The Cancer Genome Atlas	Lung Adenocarcinoma	SYPL2	0.09	0.14	enet	13	0.14	1.3e-16	-7.56	-6.8	1.5e-11	0.88	0.05	0.95	FALSE
43	The Cancer Genome Atlas	Kidney Renal Papillary Cell Carcinoma	SYPL2	0.04	0.04	blup	45	0.04	3.6e-03	-7.49	6.7	2.7e-11	-0.88	0.02	0.60	FALSE
49	The Cancer Genome Atlas	Lung Squamous Cell Carcinoma	SYPL2	0.05	0.06	blup	45	0.06	4.4e-07	-7.76	-6.6	3.2e-11	0.90	0.02	0.98	FALSE
56	The Cancer Genome Atlas	Stomach Adenocarcinoma	SORT1	0.04	0.01	blup	60	0.03	4.4e-03	-3.38	-6.6	3.4e-11	0.75	0.02	0.31	FALSE
58	The Cancer Genome Atlas	Testicular Germ Cell Tumors	AMIGO1	0.14	0.14	blup	46	0.14	1.1e-05	-5.04	-6.6	4.6e-11	0.58	0.39	0.36	FALSE
38	The Cancer Genome Atlas	Breast Invasive Carcinoma	SYPL2	0.06	0.07	blup	45	0.08	8.5e-16	-7.54	-6.6	4.9e-11	0.86	0.05	0.95	FALSE
39	The Cancer Genome Atlas	Esophageal Carcinoma	AMIGO1	0.24	0.08	blup	46	0.18	3.0e-06	-4.54	-6.5	6.1e-11	0.56	0.09	0.32	FALSE
57	The Cancer Genome Atlas	Stomach Adenocarcinoma	SYPL2	0.05	0.02	blup	45	0.03	2.6e-03	-7.56	-6.5	1.1e-10	0.87	0.02	0.80	FALSE
16	GTEx	Lung	SYPL2	0.24	0.20	enet	16	0.28	1.6e-21	-6.50	-6.4	1.5e-10	0.84	0.33	0.67	FALSE
18	GTEx	Muscle Skeletal	SYPL2	0.20	0.21	lasso	2	0.21	1.5e-20	-6.39	-6.4	1.5e-10	0.77	1.00	0.00	FALSE
54	The Cancer Genome Atlas	Stomach Adenocarcinoma	CELSR2	0.08	0.00	blup	62	0.02	8.1e-03	-7.80	-6.3	2.1e-10	0.61	0.01	0.42	FALSE
37	The Cancer Genome Atlas	Bladder Urothelial Carcinoma	AMIGO1	0.10	0.14	enet	10	0.11	2.8e-09	-5.04	-6.3	2.2e-10	0.57	1.00	0.00	FALSE
31	GTEx	Thyroid	ATXN7L2	0.15	0.15	lasso	6	0.15	1.0e-11	-6.39	6.3	2.5e-10	-0.76	0.79	0.21	FALSE
28	GTEx	Testis	SORT1	0.25	0.17	lasso	6	0.17	5.2e-08	-6.53	-6.3	2.6e-10	0.84	0.09	0.90	FALSE
12	GTEx	Esophagus Muscularis	SYPL2	0.32	0.23	lasso	10	0.37	6.8e-24	-7.80	-6.2	5.0e-10	0.80	0.03	0.97	FALSE
17	GTEx	Lung	AMIGO1	0.14	0.07	enet	22	0.06	3.6e-05	-5.04	-6.0	1.7e-09	0.45	0.99	0.01	FALSE
15	GTEx	Liver	AMIGO1	0.28	0.13	lasso	7	0.15	6.9e-05	-5.04	-5.9	2.9e-09	0.50	0.24	0.20	FALSE
10	GTEx	Esophagus Mucosa	SYPL2	0.10	0.00	enet	26	0.03	4.5e-03	-7.46	-5.9	4.2e-09	0.78	0.06	0.86	FALSE
9	GTEx	Esophagus Gastroesophageal Junction	SYPL2	0.29	0.14	enet	21	0.18	3.0e-07	-7.52	-5.9	4.6e-09	0.81	0.08	0.91	FALSE
48	The Cancer Genome Atlas	Lung Squamous Cell Carcinoma	AMIGO1	0.13	0.13	blup	46	0.12	1.7e-13	-5.03	-5.8	6.0e-09	0.48	1.00	0.00	FALSE
40	The Cancer Genome Atlas	Glioblastoma Multiforme	AMIGO1	0.20	0.05	lasso	7	0.07	3.1e-03	-5.04	-5.8	6.6e-09	0.51	0.03	0.33	FALSE
1	GTEx	Brain Caudate basal ganglia	AMIGO1	0.17	0.00	enet	10	0.00	4.4e-01	5.78	-5.8	6.8e-09	0.56	0.08	0.17	FALSE
27	GTEx	Stomach	AMIGO1	0.15	0.07	lasso	3	0.06	8.1e-04	-5.04	-5.8	7.7e-09	0.47	0.46	0.18	FALSE
25	GTEx	Skin Sun Exposed Lower leg	AMIGO1	0.39	0.36	enet	26	0.40	1.0e-35	-5.04	-5.8	7.8e-09	0.38	1.00	0.00	FALSE
46	The Cancer Genome Atlas	Lung Adenocarcinoma	AMIGO1	0.10	0.14	enet	10	0.12	2.0e-13	-5.03	-5.7	1.3e-08	0.45	1.00	0.00	FALSE
7	GTEx	Cells Transformed fibroblasts	AMIGO1	0.39	0.38	enet	22	0.43	1.7e-34	-5.04	-5.6	2.0e-08	0.39	1.00	0.00	FALSE
52	The Cancer Genome Atlas	Pancreatic Adenocarcinoma	AMIGO1	0.20	0.24	enet	7	0.16	2.3e-07	-5.04	-5.5	4.3e-08	0.43	0.99	0.01	FALSE
41	The Cancer Genome Atlas	Head and Neck Squamous Cell Carcinoma	AMIGO1	0.17	0.20	enet	9	0.18	2.1e-19	-5.04	-5.4	6.4e-08	0.41	1.00	0.00	FALSE
55	The Cancer Genome Atlas	Stomach Adenocarcinoma	PSRC1	0.12	0.03	enet	6	0.08	1.5e-06	-3.38	-5.4	7.0e-08	0.34	0.16	0.26	FALSE
5	GTEx	Brain Cortex	AC000032.2	0.37	0.01	enet	17	0.13	2.1e-04	-0.89	-5.3	1.0e-07	0.39	0.09	0.15	FALSE
59	The Cancer Genome Atlas	Thyroid Carcinoma	AMIGO1	0.14	0.16	enet	6	0.16	1.7e-15	-5.04	-5.3	1.0e-07	0.40	1.00	0.00	FALSE
35	ROSMAP	Brain Pre-frontal Cortex	SYPL2	0.03	0.01	lasso	3	0.01	9.8e-03	-6.39	-5.3	1.1e-07	0.66	0.07	0.64	FALSE
24	GTEx	Skin Not Sun Exposed Suprapubic	AMIGO1	0.43	0.36	lasso	6	0.33	7.7e-19	-5.04	-5.3	1.4e-07	0.40	1.00	0.00	FALSE
11	GTEx	Esophagus Mucosa	AMIGO1	0.43	0.38	enet	39	0.39	2.0e-27	-5.04	-5.2	2.4e-07	0.40	1.00	0.00	FALSE
6	GTEx	Breast Mammary Tissue	AMIGO1	0.24	0.21	lasso	2	0.21	6.1e-11	-5.04	-5.1	2.7e-07	0.34	1.00	0.00	FALSE
20	GTEx	Nerve Tibial	AMIGO1	0.36	0.33	lasso	6	0.33	4.4e-24	-5.04	-5.1	2.9e-07	0.35	1.00	0.00	FALSE
36	ROSMAP	Brain Pre-frontal Cortex	ATXN7L2	0.07	0.06	enet	12	0.09	5.6e-12	-7.52	5.1	3.1e-07	-0.70	0.20	0.80	FALSE