[Hub]/) : Traits : High blood pressure :

chr20:61,522,825-62,912,463

Best TWAS P=2.52e-12 · Best GWAS P=4.71e-12 conditioned to 1

Associated models

# Study Tissue Gene h2 eQTL R2 model # weights model R2 model R2 P eQTL GWAS Z TWAS Z TWAS P Top SNP corr PP3 PP4 joint
1 CommonMind Brain Pre-frontal Cortex LIME1 0.04 0.00 bslmm 439 0.01 3.3e-02 -3.4 5.3 9.5e-08 -0.17 0.28 0.04 TRUE
2 CommonMind Brain Pre-frontal Cortex TPD52L2 0.13 0.07 bslmm 418 0.08 4.5e-10 -4.9 5.8 7.3e-09 -0.36 0.72 0.27 FALSE
3 CommonMind Brain Pre-frontal Cortex ZBTB46 0.11 0.08 lasso 3 0.07 1.2e-08 -6.9 -7.0 2.5e-12 1.00 0.00 1.00 TRUE
4 GTEx Adrenal Gland OPRL1 0.48 0.29 enet 21 0.22 1.5e-08 -5.9 -5.5 4.9e-08 0.31 0.50 0.50 FALSE
5 GTEx Adrenal Gland RGS19 0.32 0.20 lasso 8 0.21 5.8e-08 -5.9 -6.1 8.5e-10 0.26 0.28 0.41 FALSE
6 GTEx Artery Aorta TPD52L2 0.16 0.07 enet 15 0.16 4.4e-09 1.8 -5.5 2.9e-08 0.20 0.70 0.04 TRUE
7 GTEx Artery Aorta OPRL1 0.27 0.19 lasso 4 0.17 1.4e-09 -5.9 -6.8 8.9e-12 0.35 0.38 0.62 FALSE
8 GTEx Artery Aorta TCEA2 0.09 0.04 lasso 3 0.03 1.3e-02 -5.9 6.3 2.3e-10 -0.23 0.31 0.28 FALSE
9 GTEx Artery Tibial OPRL1 0.10 0.10 lasso 2 0.06 1.1e-05 -5.9 -6.0 2.1e-09 0.26 0.40 0.56 FALSE
10 GTEx Artery Tibial RGS19 0.12 0.07 lasso 2 0.07 2.8e-06 5.5 -5.3 9.5e-08 0.25 0.75 0.20 FALSE
11 GTEx Brain Cerebellar Hemisphere OPRL1 0.27 0.14 lasso 7 0.17 4.4e-05 -5.9 -5.2 1.5e-07 0.27 0.09 0.10 FALSE
12 GTEx Brain Cerebellum RGS19 0.28 0.22 lasso 4 0.18 7.2e-06 -5.9 -5.4 5.7e-08 0.27 0.20 0.24 FALSE
13 GTEx Breast Mammary Tissue GMEB2 0.18 0.02 lasso 5 0.06 3.0e-04 -3.4 -5.3 1.1e-07 0.11 0.16 0.04 FALSE
14 GTEx Cells Transformed fibroblasts RGS19 0.37 0.28 lasso 8 0.29 3.2e-22 5.5 -5.7 1.3e-08 0.26 0.84 0.16 FALSE
15 GTEx Colon Sigmoid RGS19 0.27 0.07 enet 33 0.09 3.8e-04 -4.2 -5.9 3.4e-09 0.38 0.43 0.20 FALSE
16 GTEx Esophagus Mucosa RGS19 0.43 0.28 enet 17 0.34 7.9e-24 -5.9 -6.2 4.4e-10 0.30 0.50 0.50 FALSE
17 GTEx Esophagus Muscularis OPRL1 0.17 0.14 lasso 1 0.13 4.7e-08 -5.9 -5.9 3.4e-09 0.25 0.38 0.60 FALSE
18 GTEx Esophagus Muscularis RGS19 0.22 0.10 lasso 4 0.10 1.6e-06 -5.9 -5.5 3.0e-08 0.26 0.43 0.54 FALSE
19 GTEx Muscle Skeletal RGS19 0.26 0.16 lasso 4 0.16 5.1e-15 5.5 -5.3 1.0e-07 0.27 0.89 0.11 FALSE
20 GTEx Nerve Tibial OPRL1 0.20 0.15 lasso 3 0.14 3.3e-10 -5.9 -6.3 3.6e-10 0.24 0.38 0.62 FALSE
21 GTEx Pancreas OPRL1 0.39 0.27 lasso 5 0.32 6.9e-14 -5.9 -5.7 1.1e-08 0.27 0.48 0.52 FALSE
22 GTEx Skin Not Sun Exposed Suprapubic RGS19 0.51 0.28 enet 28 0.32 4.3e-18 -5.9 -5.8 5.9e-09 0.23 0.41 0.59 FALSE
23 GTEx Skin Sun Exposed Lower leg OPRL1 0.14 0.10 lasso 6 0.11 4.4e-09 5.5 -5.8 6.3e-09 0.27 0.63 0.37 FALSE
24 GTEx Skin Sun Exposed Lower leg RGS19 0.42 0.26 lasso 6 0.33 4.6e-28 -5.9 -6.0 2.5e-09 0.28 0.53 0.47 FALSE
25 GTEx Stomach OPRL1 0.36 0.23 enet 16 0.19 1.3e-09 -5.9 -6.6 5.0e-11 0.28 0.39 0.61 FALSE
26 GTEx Stomach RGS19 0.18 0.25 lasso 2 0.25 2.2e-12 -5.9 -6.0 2.5e-09 0.25 0.38 0.62 FALSE
27 GTEx Thyroid RGS19 0.23 0.14 enet 11 0.19 3.3e-14 5.5 -5.8 6.9e-09 0.35 0.70 0.30 FALSE
28 GTEx Vagina RGS19 0.39 0.08 lasso 8 0.03 7.5e-02 5.5 -6.4 2.1e-10 0.27 0.06 0.08 FALSE
29 GTEx Whole Blood OPRL1 0.09 0.06 enet 8 0.07 4.3e-07 5.6 5.6 2.7e-08 -0.26 0.70 0.28 FALSE
30 ROSMAP Brain Pre-frontal Cortex ZBTB46 0.11 0.07 lasso 1 0.06 5.2e-08 -6.9 -6.9 4.7e-12 1.00 0.00 1.00 FALSE
31 YFS Blood OPRL1 0.07 0.07 lasso 5 0.09 5.0e-27 -5.9 5.2 1.5e-07 -0.26 0.49 0.51 FALSE
32 The Cancer Genome Atlas Breast Invasive Carcinoma RGS19 0.03 0.02 blup 48 0.02 6.9e-06 5.2 -5.5 3.5e-08 0.14 0.02 0.97 FALSE
33 The Cancer Genome Atlas Head and Neck Squamous Cell Carcinoma RGS19 0.06 0.06 blup 47 0.05 1.4e-06 -5.9 -5.2 1.6e-07 0.22 0.00 1.00 FALSE
34 The Cancer Genome Atlas Brain Lower Grade Glioma OPRL1 0.03 0.02 lasso 1 0.01 3.5e-02 -5.9 -5.9 3.4e-09 0.25 0.00 0.98 FALSE
35 The Cancer Genome Atlas Pancreatic Adenocarcinoma RGS19 0.11 0.00 blup 48 0.03 1.7e-02 5.2 -5.9 3.2e-09 0.19 0.02 0.55 TRUE
36 The Cancer Genome Atlas Prostate Adenocarcinoma RGS19 0.07 0.05 blup 48 0.07 1.1e-07 -4.3 -6.1 9.6e-10 0.28 0.05 0.95 FALSE
37 The Cancer Genome Atlas Thyroid Carcinoma UCKL1AS 0.05 0.02 blup 41 0.03 4.6e-04 4.3 -5.6 1.6e-08 0.16 0.05 0.44 FALSE