[Hub]/) : Traits : Worrier / anxious feelings : ← →

chr3:51,616,334-54,077,726

Best TWAS P=1.24e-13 · Best GWAS P=1.25e-11 conditioned to 0.115

Associated models

#	Study	Tissue	Gene	h2	eQTL R2	model	# weights	model R2	model R2 P	eQTL GWAS Z	TWAS Z	TWAS P	Top SNP corr	PP3	PP4	joint
1	CommonMind	Brain Pre-frontal Cortex	ITIH4	0.22	0.21	lasso	8	0.21	7.0e-25	-6.0	-5.5	4.9e-08	0.88	0.35	0.65	FALSE
2	CommonMind	Brain Pre-frontal Cortex	SFMBT1	0.13	0.10	enet	23	0.12	4.4e-14	-6.7	-6.2	5.6e-10	0.93	0.02	0.98	FALSE
3	CommonMind	Brain Pre-frontal Cortex	TMEM110	0.07	0.07	lasso	4	0.07	8.9e-09	-6.6	-6.3	3.1e-10	0.97	0.03	0.97	FALSE
4	GTEx	Adipose Subcutaneous	ITIH4-AS1	0.03	0.06	lasso	2	0.04	6.7e-04	-6.1	-6.2	5.8e-10	0.82	0.14	0.65	FALSE
5	GTEx	Adipose Subcutaneous	RP5-966M1.6	0.15	0.11	enet	24	0.12	4.9e-10	-6.4	-5.1	2.7e-07	0.85	0.13	0.87	FALSE
6	GTEx	Adipose Visceral Omentum	RP5-966M1.6	0.18	0.12	lasso	12	0.09	1.6e-05	-6.1	-6.0	2.4e-09	0.90	0.07	0.92	FALSE
7	GTEx	Adrenal Gland	RP5-966M1.6	0.11	0.07	lasso	5	0.05	6.6e-03	-5.8	-5.9	3.7e-09	0.86	0.08	0.75	FALSE
8	GTEx	Artery Aorta	NT5DC2	0.08	0.10	lasso	2	0.06	3.4e-04	5.3	-5.3	9.5e-08	0.47	0.46	0.04	FALSE
9	GTEx	Artery Aorta	TMEM110	0.19	0.08	enet	16	0.10	6.0e-06	-5.9	-5.7	1.1e-08	0.85	0.15	0.85	FALSE
10	GTEx	Artery Aorta	ITIH4-AS1	0.38	0.45	lasso	10	0.42	1.4e-24	-5.9	-6.1	1.0e-09	0.91	0.16	0.84	FALSE
11	GTEx	Artery Aorta	RP5-966M1.6	0.27	0.30	enet	28	0.26	2.0e-14	-6.4	-5.3	9.3e-08	0.89	0.06	0.94	FALSE
12	GTEx	Artery Aorta	MUSTN1	0.15	0.14	lasso	6	0.11	9.5e-07	-6.1	-6.6	5.0e-11	0.94	0.04	0.96	FALSE
13	GTEx	Artery Coronary	ITIH4-AS1	0.11	0.12	enet	20	0.16	5.5e-06	-5.9	-5.6	2.2e-08	0.78	0.14	0.81	FALSE
14	GTEx	Artery Coronary	RP5-966M1.6	0.20	0.15	lasso	8	0.15	1.2e-05	-6.5	-6.7	2.5e-11	0.96	0.02	0.98	FALSE
15	GTEx	Artery Tibial	ITIH4-AS1	0.68	0.49	lasso	6	0.52	5.5e-47	-5.8	-6.3	2.3e-10	0.92	0.29	0.71	FALSE
16	GTEx	Brain Caudate basal ganglia	RFT1	0.30	0.23	enet	14	0.22	5.4e-07	3.1	5.2	1.9e-07	-0.79	0.15	0.79	FALSE
17	GTEx	Brain Cerebellum	GNL3	0.14	0.07	enet	43	0.09	1.3e-03	-3.3	5.2	2.4e-07	-0.74	0.43	0.33	FALSE
18	GTEx	Brain Cerebellum	ITIH4-AS1	0.25	0.00	lasso	16	0.05	1.5e-02	-5.9	-5.4	6.3e-08	0.81	0.04	0.88	FALSE
19	GTEx	Brain Cortex	RFT1	0.31	0.17	enet	14	0.30	5.9e-09	3.1	5.5	3.0e-08	-0.79	0.09	0.91	FALSE
20	GTEx	Brain Hippocampus	TMEM110	0.17	0.11	lasso	7	0.13	5.1e-04	-4.2	-5.3	9.6e-08	0.66	0.05	0.44	FALSE
21	GTEx	Brain Nucleus accumbens basal ganglia	TMEM110	0.13	0.07	lasso	3	0.05	1.5e-02	-3.9	-5.3	9.7e-08	0.81	0.07	0.52	FALSE
22	GTEx	Brain Putamen basal ganglia	ITIH4-AS1	0.18	0.00	enet	23	0.06	1.8e-02	-6.4	-7.4	1.2e-13	0.78	0.06	0.43	TRUE
23	GTEx	Breast Mammary Tissue	NEK4	0.06	0.03	enet	7	0.06	7.8e-04	5.2	6.8	1.3e-11	-0.72	0.14	0.48	FALSE
24	GTEx	Breast Mammary Tissue	NT5DC2	0.13	0.12	enet	11	0.08	9.9e-05	5.1	6.1	1.1e-09	-0.70	0.36	0.52	FALSE
25	GTEx	Breast Mammary Tissue	RP5-966M1.6	0.08	0.15	lasso	2	0.14	1.1e-07	-5.9	-5.9	4.7e-09	0.90	0.29	0.70	FALSE
26	GTEx	Breast Mammary Tissue (Female)	RP5-966M1.6	0.03	-0.01	lasso	2	0.01	2.1e-01	-5.8	-5.8	4.8e-09	0.90	0.04	0.24	FALSE
27	GTEx	Cells EBV-transformed lymphocytes	NT5DC2	0.18	0.29	lasso	1	0.28	6.6e-10	5.2	5.2	2.3e-07	-0.47	0.89	0.02	FALSE
28	GTEx	Cells EBV-transformed lymphocytes	TMEM110	0.13	0.00	enet	11	0.04	1.6e-02	-5.1	-6.7	2.8e-11	0.70	0.17	0.19	FALSE
29	GTEx	Cells EBV-transformed lymphocytes	ITIH4-AS1	0.11	0.05	enet	10	0.02	5.1e-02	5.1	-6.2	6.0e-10	0.66	0.18	0.26	FALSE
30	GTEx	Cells EBV-transformed lymphocytes	RP5-966M1.6	0.16	0.07	enet	19	0.11	1.8e-04	-5.9	-5.9	3.7e-09	0.78	0.35	0.57	FALSE
31	GTEx	Cells Transformed fibroblasts	NT5DC2	0.30	0.17	enet	23	0.18	1.3e-13	5.2	5.2	1.7e-07	-0.51	0.98	0.02	FALSE
32	GTEx	Colon Sigmoid	ITIH4-AS1	0.25	0.18	lasso	5	0.19	3.2e-07	-5.9	-5.4	8.1e-08	0.88	0.12	0.87	FALSE
33	GTEx	Colon Transverse	NT5DC2	0.12	0.18	lasso	12	0.17	1.6e-08	5.2	5.3	1.5e-07	-0.51	0.96	0.03	FALSE
34	GTEx	Colon Transverse	ITIH4-AS1	0.20	0.03	lasso	4	0.05	2.4e-03	-6.1	-6.1	1.1e-09	0.80	0.03	0.92	FALSE
35	GTEx	Colon Transverse	RP5-966M1.6	0.10	0.03	lasso	3	0.05	1.6e-03	-6.1	-5.5	3.1e-08	0.77	0.04	0.85	FALSE
36	GTEx	Esophagus Mucosa	NEK4	0.05	0.03	lasso	8	0.02	2.4e-02	4.5	5.8	4.9e-09	-0.61	0.38	0.47	FALSE
37	GTEx	Esophagus Mucosa	ITIH4-AS1	0.06	0.03	lasso	3	0.05	2.2e-04	-6.2	-5.7	1.1e-08	0.80	0.04	0.94	FALSE
38	GTEx	Esophagus Mucosa	RP5-966M1.6	0.11	0.14	lasso	4	0.14	9.5e-10	-6.2	-6.4	1.2e-10	0.89	0.09	0.91	FALSE
39	GTEx	Heart Atrial Appendage	RP5-966M1.6	0.22	0.10	lasso	8	0.11	1.6e-05	-6.6	-5.5	3.2e-08	0.91	0.03	0.97	FALSE
40	GTEx	Heart Left Ventricle	RP5-966M1.6	0.12	0.11	lasso	2	0.10	8.3e-06	-6.1	-6.2	4.6e-10	0.92	0.06	0.93	FALSE
41	GTEx	Liver	DCP1A	0.20	0.01	lasso	4	0.02	6.9e-02	-6.6	6.0	2.1e-09	-0.88	0.04	0.56	FALSE
42	GTEx	Liver	RP5-966M1.6	0.41	0.30	lasso	4	0.29	7.7e-09	-6.1	-6.0	2.7e-09	0.90	0.10	0.89	FALSE
43	GTEx	Lung	GNL3	0.05	0.03	lasso	6	0.03	3.0e-03	-4.4	5.2	2.2e-07	-0.77	0.37	0.48	FALSE
44	GTEx	Lung	TMEM110	0.13	0.10	lasso	7	0.07	8.4e-06	-6.4	-5.8	6.0e-09	0.89	0.04	0.96	FALSE
45	GTEx	Lung	ITIH4-AS1	0.32	0.26	lasso	6	0.26	8.0e-20	-6.1	-6.2	6.8e-10	0.92	0.19	0.81	FALSE
46	GTEx	Lung	RP5-966M1.6	0.36	0.24	lasso	8	0.26	6.4e-20	-5.9	-5.5	5.0e-08	0.88	0.26	0.74	FALSE
47	GTEx	Muscle Skeletal	TMEM110	0.13	0.08	lasso	11	0.14	1.1e-13	-4.4	-6.0	2.6e-09	0.80	0.23	0.77	FALSE
48	GTEx	Muscle Skeletal	ITIH4-AS1	0.06	0.03	lasso	4	0.06	2.3e-06	-6.2	-6.1	9.0e-10	0.80	0.17	0.83	FALSE
49	GTEx	Muscle Skeletal	RP5-966M1.6	0.12	0.10	lasso	4	0.10	3.9e-10	-6.0	-6.2	4.9e-10	0.90	0.12	0.88	FALSE
50	GTEx	Nerve Tibial	ITIH4-AS1	0.19	0.22	lasso	3	0.21	1.5e-14	-6.4	-6.5	8.2e-11	0.92	0.09	0.91	FALSE
51	GTEx	Nerve Tibial	RP5-966M1.6	0.33	0.32	lasso	9	0.31	4.6e-22	-5.8	-5.8	6.1e-09	0.90	0.24	0.76	FALSE
52	GTEx	Pancreas	ITIH4-AS1	0.17	0.05	enet	27	0.07	7.6e-04	3.2	5.2	2.0e-07	-0.66	0.26	0.48	FALSE
53	GTEx	Pancreas	RP5-966M1.6	0.10	0.16	lasso	4	0.13	3.8e-06	-6.0	-5.9	3.6e-09	0.90	0.08	0.91	FALSE
54	GTEx	Pituitary	SFMBT1	0.16	0.01	enet	9	0.02	1.2e-01	-4.2	-5.8	7.1e-09	0.84	0.08	0.67	FALSE
55	GTEx	Pituitary	ITIH4-AS1	0.38	0.31	enet	15	0.33	4.5e-09	-5.9	-5.7	1.3e-08	0.85	0.08	0.90	FALSE
56	GTEx	Prostate	NEK4	0.15	0.05	enet	19	0.07	8.9e-03	-6.6	5.8	7.8e-09	-0.75	0.04	0.84	FALSE
57	GTEx	Skin Not Sun Exposed Suprapubic	ITIH4-AS1	0.12	0.04	enet	13	0.07	1.6e-04	-6.4	-5.9	3.0e-09	0.84	0.04	0.94	FALSE
58	GTEx	Skin Not Sun Exposed Suprapubic	RP5-966M1.6	0.17	0.06	lasso	5	0.04	4.2e-03	-6.1	-6.7	2.0e-11	0.91	0.04	0.92	FALSE
59	GTEx	Skin Sun Exposed Lower leg	ITIH4-AS1	0.15	0.11	enet	28	0.11	2.4e-09	-6.5	-6.0	1.8e-09	0.79	0.09	0.91	FALSE
60	GTEx	Skin Sun Exposed Lower leg	RP5-966M1.6	0.16	0.17	lasso	3	0.16	2.0e-13	-6.4	-6.3	3.3e-10	0.92	0.12	0.88	FALSE
61	GTEx	Small Intestine Terminal Ileum	RP5-966M1.6	0.14	0.03	lasso	7	0.00	2.5e-01	-4.2	-5.4	5.7e-08	0.81	0.05	0.57	FALSE
62	GTEx	Spleen	ITIH4-AS1	0.33	0.35	lasso	2	0.34	1.7e-09	-6.2	-6.2	5.0e-10	0.84	0.07	0.93	FALSE
63	GTEx	Spleen	RP5-966M1.6	0.29	0.31	enet	14	0.32	4.1e-09	-6.2	-5.9	3.7e-09	0.89	0.07	0.92	FALSE
64	GTEx	Stomach	RP5-966M1.6	0.15	0.20	enet	14	0.20	7.0e-10	-5.9	-5.6	2.0e-08	0.86	0.14	0.86	FALSE
65	GTEx	Testis	NT5DC2	0.11	0.16	enet	8	0.11	1.0e-05	5.2	5.5	5.1e-08	-0.54	0.76	0.16	FALSE
66	GTEx	Testis	RP5-966M1.6	0.14	0.10	lasso	6	0.09	6.1e-05	-6.2	-6.2	4.9e-10	0.91	0.02	0.97	FALSE
67	GTEx	Thyroid	SFMBT1	0.13	0.09	enet	13	0.10	6.3e-08	-6.6	-5.6	2.7e-08	0.91	0.02	0.98	FALSE
68	GTEx	Thyroid	NT5DC2	0.20	0.13	lasso	3	0.13	4.0e-10	5.2	5.2	1.7e-07	-0.52	0.99	0.01	FALSE
69	GTEx	Thyroid	RP5-966M1.6	0.28	0.34	lasso	10	0.36	8.5e-29	-5.8	-5.5	3.1e-08	0.88	0.14	0.86	FALSE
70	GTEx	Whole Blood	TMEM110	0.15	0.08	lasso	7	0.07	5.7e-07	-6.5	-6.2	4.2e-10	0.93	0.03	0.97	FALSE
71	GTEx	Whole Blood	ITIH4-AS1	0.33	0.24	lasso	7	0.25	9.7e-23	-6.1	-6.2	4.2e-10	0.89	0.24	0.76	FALSE
72	GTEx	Whole Blood	RP5-966M1.6	0.20	0.22	lasso	6	0.22	1.4e-19	-6.1	-6.3	2.8e-10	0.94	0.10	0.90	FALSE
73	METSIM	Adipose	ITIH4	0.35	0.24	bslmm	389	0.27	4.2e-41	-5.9	-6.0	1.4e-09	0.82	0.37	0.63	FALSE
74	NTR	Blood	ITIH4	0.05	0.05	lasso	7	0.04	2.5e-14	-6.5	-6.3	3.5e-10	0.93	0.09	0.91	FALSE
75	ROSMAP	Brain Pre-frontal Cortex	NEK4	0.04	0.05	blup	359	0.05	1.1e-06	4.2	5.2	1.9e-07	-0.59	0.80	0.19	FALSE
76	ROSMAP	Brain Pre-frontal Cortex	SFMBT1	0.07	0.02	bslmm	340	0.03	2.9e-04	-4.4	-5.7	1.3e-08	0.73	0.03	0.94	FALSE
77	ROSMAP	Brain Pre-frontal Cortex	WDR82	0.03	0.02	enet	11	0.03	1.2e-04	4.0	-5.8	8.0e-09	0.45	0.26	0.68	FALSE
78	ROSMAP	Brain Pre-frontal Cortex	TMEM110	0.02	0.01	blup	321	0.02	9.7e-04	-5.8	-5.2	2.0e-07	0.73	0.22	0.42	FALSE
79	YFS	Blood	GNL3	0.02	0.03	enet	11	0.03	2.9e-09	-4.2	5.2	2.6e-07	-0.71	1.00	0.00	FALSE
80	The Cancer Genome Atlas	Bladder Urothelial Carcinoma	ITIH4	0.04	0.03	blup	53	0.03	7.4e-04	-6.1	-6.3	2.5e-10	0.84	0.02	0.94	FALSE
81	The Cancer Genome Atlas	Breast Invasive Carcinoma	ITIH4	0.05	0.03	lasso	2	0.03	4.9e-07	-5.9	-5.9	4.4e-09	0.90	0.04	0.96	FALSE
82	The Cancer Genome Atlas	Colon Adenocarcinoma	ITIH4	0.08	0.09	blup	53	0.08	3.1e-05	-6.4	-6.0	1.9e-09	0.89	0.01	0.99	FALSE
83	The Cancer Genome Atlas	Glioblastoma Multiforme	ITIH4	0.10	0.02	blup	53	0.05	1.2e-02	-5.9	-5.8	5.3e-09	0.86	0.02	0.69	FALSE
84	The Cancer Genome Atlas	Kidney Renal Clear Cell Carcinoma	ITIH4	0.06	0.06	blup	53	0.06	5.1e-07	-6.5	-5.6	2.3e-08	0.88	0.01	0.99	FALSE
85	The Cancer Genome Atlas	Kidney Renal Papillary Cell Carcinoma	ITIH4	0.23	0.01	enet	7	0.02	1.6e-02	-4.4	-6.3	3.0e-10	0.82	0.02	0.97	FALSE
86	The Cancer Genome Atlas	Brain Lower Grade Glioma	ITIH4	0.17	0.16	lasso	5	0.14	3.1e-15	-5.9	-6.1	1.1e-09	0.90	0.05	0.95	FALSE
87	The Cancer Genome Atlas	Lung Adenocarcinoma	ITIH4	0.07	0.06	enet	6	0.06	2.4e-07	-5.9	-6.1	8.7e-10	0.90	0.02	0.98	FALSE
88	The Cancer Genome Atlas	Lung Squamous Cell Carcinoma	ITIH4	0.14	0.08	lasso	3	0.10	7.0e-12	-6.1	-6.5	7.0e-11	0.87	0.02	0.98	FALSE
89	The Cancer Genome Atlas	Ovarian Serous Cystadenocarcinoma	ITIH4	0.05	0.02	blup	53	0.02	1.1e-02	-6.1	-6.4	1.7e-10	0.88	0.02	0.85	FALSE
90	The Cancer Genome Atlas	Pheochromocytoma and Paraganglioma	ITIH4	0.25	0.16	blup	53	0.15	1.6e-06	-6.5	-5.4	6.2e-08	0.85	0.01	0.99	FALSE
91	The Cancer Genome Atlas	Prostate Adenocarcinoma	ITIH4	0.13	0.07	lasso	5	0.05	2.3e-06	-5.9	-5.7	1.4e-08	0.90	0.02	0.98	FALSE
92	The Cancer Genome Atlas	Rectum Adenocarcinoma	ITIH4	0.12	0.09	blup	53	0.06	1.4e-02	-4.4	-5.4	6.8e-08	0.73	0.03	0.42	FALSE
93	The Cancer Genome Atlas	Soft Tissue Sarcoma	ITIH4	0.03	0.03	lasso	4	0.03	5.1e-03	-5.7	-6.1	1.2e-09	0.80	0.02	0.70	FALSE
94	The Cancer Genome Atlas	Thyroid Carcinoma	ITIH4	0.20	0.12	enet	8	0.16	6.0e-15	-6.1	-6.2	7.8e-10	0.86	0.01	0.99	FALSE
95	The Cancer Genome Atlas	Thyroid Carcinoma	PBRM1	0.15	0.14	enet	9	0.16	7.0e-15	4.6	-5.2	1.7e-07	0.60	0.05	0.94	FALSE